More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13534 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  100 
 
 
280 aa  549  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  87.86 
 
 
280 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  87.5 
 
 
280 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  87.5 
 
 
280 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  87.86 
 
 
280 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  87.14 
 
 
280 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  75 
 
 
280 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  66.3 
 
 
282 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  63.64 
 
 
285 aa  358  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  63.64 
 
 
285 aa  358  4e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  63.64 
 
 
285 aa  358  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  64.84 
 
 
282 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  63.04 
 
 
285 aa  352  5e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  63.04 
 
 
285 aa  352  5e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  62.32 
 
 
285 aa  348  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  64.49 
 
 
285 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  63.16 
 
 
285 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  64.36 
 
 
281 aa  332  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  58.96 
 
 
284 aa  327  9e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  68.35 
 
 
283 aa  327  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  56.32 
 
 
284 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  58.7 
 
 
285 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  56.04 
 
 
284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  60.73 
 
 
284 aa  318  6e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  55.47 
 
 
281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  59.71 
 
 
284 aa  311  6.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  60.45 
 
 
284 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  58.48 
 
 
284 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  60.15 
 
 
272 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  50.92 
 
 
275 aa  293  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  51.66 
 
 
275 aa  292  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  50.18 
 
 
279 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  50.56 
 
 
279 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  52.33 
 
 
290 aa  279  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  50.96 
 
 
281 aa  279  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  48.33 
 
 
279 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  50.19 
 
 
282 aa  275  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  49.45 
 
 
279 aa  275  7e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  53.76 
 
 
297 aa  271  7e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  52.49 
 
 
262 aa  268  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  49.42 
 
 
271 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  53.41 
 
 
296 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  53.41 
 
 
296 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  53.44 
 
 
289 aa  259  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  46.32 
 
 
285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  46.32 
 
 
285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  46.32 
 
 
285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  46.32 
 
 
285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  52.67 
 
 
295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  49.82 
 
 
289 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  40.36 
 
 
286 aa  208  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  46.64 
 
 
288 aa  205  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  39.62 
 
 
287 aa  202  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  40.61 
 
 
285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  37.04 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  37.55 
 
 
285 aa  195  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  39.13 
 
 
288 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  40.61 
 
 
284 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  41.63 
 
 
288 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  45.27 
 
 
288 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  36.19 
 
 
281 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1651  putative ABC transport system permease protein  44.72 
 
 
161 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1653  hypothetical protein  46.55 
 
 
116 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  36.67 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  31.45 
 
 
251 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  31.45 
 
 
251 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  31.45 
 
 
251 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  35.14 
 
 
262 aa  89.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  28.8 
 
 
264 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  27.11 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  29.06 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0663  hypothetical protein  27.92 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680896  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  32 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  29.57 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  27 
 
 
261 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0480  putative ABC transport system permease protein  30.37 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.192748  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  27.84 
 
 
256 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  31.16 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  29.44 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  28.51 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  29.59 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  27.52 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  28.9 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  29.07 
 
 
257 aa  82  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2252  protein of unknown function DUF140  29.41 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  32.32 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  26.54 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  27.42 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  27.84 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  28.46 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  31.02 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  26.42 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  30.81 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1737  protein of unknown function DUF140  31.02 
 
 
264 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  28.14 
 
 
249 aa  79  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  29.95 
 
 
263 aa  79  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  30.29 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0442  putative ABC transport system permease protein  25.56 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  30.77 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  27.44 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>