More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2987 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 288 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  53.47 
 
 		 285 aa  323  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  51.04 
 
 		 285 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  43.97 
 
 		 285 aa  265  8e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  44.06 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  46.93 
 
 		 279 aa  257  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  45.62 
 
 		 275 aa  249  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  46.49 
 
 		 275 aa  246  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  44.98 
 
 		 279 aa  241  9e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  46.72 
 
 		 279 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  43.73 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  46.36 
 
 		 281 aa  238  9e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  45.42 
 
 		 284 aa  237  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  41.94 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  45.05 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  48.66 
 
 		 262 aa  222  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  42.13 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  42.2 
 
 		 280 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  40.67 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  40.67 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  40.67 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  38.89 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  42.37 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  41.33 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  38.89 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  42.37 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  40 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  38.54 
 
 		 285 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  40 
 
 		 282 aa  205  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  42.91 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  41.89 
 
 		 280 aa  199  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  41.13 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  38.77 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  39.62 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  42.02 
 
 		 271 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  39.62 
 
 		 285 aa  189  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  42.55 
 
 		 288 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  38.77 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  38.77 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  36.59 
 
 		 290 aa  185  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  42.26 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  38.64 
 
 		 289 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  37.5 
 
 		 284 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  38.76 
 
 		 284 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  38.76 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  38.19 
 
 		 284 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  36.81 
 
 		 284 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  36.11 
 
 		 285 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  36.82 
 
 		 284 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  41.63 
 
 		 280 aa  165  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  37.85 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  36.4 
 
 		 281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  37.36 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  35.79 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  39.92 
 
 		 283 aa  155  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  36.88 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  38.37 
 
 		 285 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  38.37 
 
 		 285 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  38.37 
 
 		 285 aa  142  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  38.37 
 
 		 285 aa  142  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  35.38 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  31.64 
 
 		 251 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  31.25 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  31.25 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  30.35 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  29.1 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17511  putative transporter, membrane component  31.19 
 
 		 249 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  27.47 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0895  putative transporter, membrane component  30.88 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.378431  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  29.44 
 
 		 267 aa  99  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  30.62 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  29.19 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  27.69 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  26.83 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1422  putative transporter, membrane component  29.17 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  30.93 
 
 		 270 aa  96.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13781  putative transporter, membrane component  30.66 
 
 		 248 aa  95.5  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.539878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15241  putative transporter, membrane component  29.17 
 
 		 251 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0680677  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15101  putative transporter, membrane component  29.17 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  28.1 
 
 		 260 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  27.9 
 
 		 328 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  28.25 
 
 		 258 aa  93.2  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  28.31 
 
 		 260 aa  92.8  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  28.44 
 
 		 260 aa  92.8  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05671  putative transporter, membrane component  28.7 
 
 		 248 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  27.45 
 
 		 264 aa  92.4  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 		 260 aa  92  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  29.49 
 
 		 249 aa  92  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  28.57 
 
 		 260 aa  92  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14851  putative transporter, membrane component  28.83 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  30 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  30.96 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  31.58 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  29.83 
 
 		 375 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  31.84 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  31.87 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  31.87 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  27.8 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  31.63 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  29.38 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>