More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3951 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 283 aa  556  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  73.46 
 
 		 280 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  72.31 
 
 		 280 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  72.31 
 
 		 280 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  69.06 
 
 		 280 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  69.78 
 
 		 280 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  65.68 
 
 		 280 aa  363  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  64.58 
 
 		 282 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  64.93 
 
 		 285 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  64.55 
 
 		 285 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  64.55 
 
 		 285 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  67.18 
 
 		 285 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  67.18 
 
 		 285 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  67.18 
 
 		 285 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  66.02 
 
 		 282 aa  355  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  68.73 
 
 		 281 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  67.69 
 
 		 285 aa  337  9e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  67.18 
 
 		 285 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  68.35 
 
 		 280 aa  331  7.000000000000001e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  60.15 
 
 		 284 aa  327  9e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  59 
 
 		 284 aa  322  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  60.54 
 
 		 285 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  61.15 
 
 		 284 aa  315  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  59.35 
 
 		 284 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  53.79 
 
 		 284 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  62.6 
 
 		 290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  55.15 
 
 		 281 aa  300  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  53.28 
 
 		 279 aa  298  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  64.73 
 
 		 297 aa  298  9e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  55.38 
 
 		 275 aa  293  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  52.71 
 
 		 282 aa  289  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  56.68 
 
 		 284 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  60.97 
 
 		 289 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  53.85 
 
 		 281 aa  287  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  64.34 
 
 		 296 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  64.34 
 
 		 296 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  53.82 
 
 		 271 aa  286  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  59.14 
 
 		 284 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  61.15 
 
 		 272 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  51.82 
 
 		 279 aa  282  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  50.74 
 
 		 275 aa  282  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  51.71 
 
 		 279 aa  281  7.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  53.28 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  51.79 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  51.61 
 
 		 285 aa  260  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  51.61 
 
 		 285 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  51.61 
 
 		 285 aa  260  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  51.61 
 
 		 285 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  57.91 
 
 		 289 aa  259  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  60.47 
 
 		 295 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  49.79 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  46.54 
 
 		 288 aa  208  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  40.15 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  43.6 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  39.41 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  46.03 
 
 		 288 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  43.6 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  41.2 
 
 		 286 aa  195  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  38.32 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  39.92 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  35.13 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  33.75 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1653  hypothetical protein  52.59 
 
 		 116 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1651  putative ABC transport system permease protein  50.32 
 
 		 161 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  30.89 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  35 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  35 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  34.5 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  32.49 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  33.17 
 
 		 257 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  31.79 
 
 		 257 aa  92.4  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  26.34 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  32.09 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  31 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  32.98 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  31.15 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  30.05 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  29.67 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  26.95 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  31.25 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  32.14 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  30.15 
 
 		 257 aa  87.4  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  31.17 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  29.56 
 
 		 312 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  30 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  30.16 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2412  hypothetical protein  26.89 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.819451  normal  0.102751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  29.35 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  33.51 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2252  protein of unknown function DUF140  32.04 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  30.08 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  31 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  27.86 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  28.74 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  29.06 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  29.96 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  27.5 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  31.61 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0663  hypothetical protein  30.94 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680896  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  31.61 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>