More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4400 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  550  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  66.3 
 
 
284 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  67.77 
 
 
284 aa  360  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  64.06 
 
 
284 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  63.77 
 
 
284 aa  350  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  62.13 
 
 
285 aa  346  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  66.55 
 
 
284 aa  345  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  67.65 
 
 
272 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  62.13 
 
 
284 aa  340  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  64.71 
 
 
284 aa  324  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  57.56 
 
 
280 aa  318  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  56.57 
 
 
280 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  56.57 
 
 
280 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  59.93 
 
 
271 aa  315  4e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  61.48 
 
 
285 aa  311  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  61.48 
 
 
285 aa  311  6.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  61.48 
 
 
285 aa  311  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  61.48 
 
 
285 aa  311  6.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  54.58 
 
 
282 aa  308  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  55.31 
 
 
285 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  55.31 
 
 
285 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  55.31 
 
 
285 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  55.68 
 
 
282 aa  308  9e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  55 
 
 
280 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  54.95 
 
 
285 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  54.95 
 
 
285 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  54.58 
 
 
285 aa  295  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  55.47 
 
 
280 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  56.78 
 
 
285 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  56.32 
 
 
285 aa  293  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  55.11 
 
 
280 aa  292  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  55.51 
 
 
290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  54.04 
 
 
297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  54.84 
 
 
281 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  57.04 
 
 
289 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  55.47 
 
 
280 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  50.55 
 
 
279 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  53.68 
 
 
296 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  53.68 
 
 
296 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  51.14 
 
 
275 aa  259  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  50.37 
 
 
281 aa  256  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  55.15 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  45.36 
 
 
282 aa  253  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  49.04 
 
 
279 aa  251  8.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  47.89 
 
 
275 aa  249  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  52.29 
 
 
262 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  46.74 
 
 
279 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  49.21 
 
 
279 aa  239  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  55.13 
 
 
289 aa  238  8e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  51.58 
 
 
295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  40.08 
 
 
287 aa  203  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  37.17 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  40.37 
 
 
285 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  41.25 
 
 
288 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  37.41 
 
 
285 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  41.6 
 
 
288 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  38.13 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  40.15 
 
 
284 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  36.07 
 
 
281 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  38.66 
 
 
288 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1651  putative ABC transport system permease protein  60.96 
 
 
161 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  37.82 
 
 
288 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1653  hypothetical protein  60.87 
 
 
116 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  38.2 
 
 
264 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  35.39 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2252  protein of unknown function DUF140  35.11 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0480  putative ABC transport system permease protein  36.7 
 
 
264 aa  85.9  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.192748  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  29.95 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  26.48 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0663  hypothetical protein  34.41 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680896  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  34.18 
 
 
256 aa  82  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1737  protein of unknown function DUF140  34.95 
 
 
264 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1694  protein of unknown function DUF140  35.64 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05671  putative transporter, membrane component  26.46 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  28.46 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  27.27 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  26.88 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  30.24 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  26.4 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3461  protein of unknown function DUF140  28.64 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0854516 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0442  putative ABC transport system permease protein  32.8 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  29.77 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  28.83 
 
 
270 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13781  putative transporter, membrane component  24.11 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.539878  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  30.54 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  29.83 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1030  hypothetical protein  29.15 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  30.51 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  27.05 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  29.39 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  28.78 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  27.97 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  27.08 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  30.54 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  32.16 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  35.95 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3789  protein of unknown function DUF140  31.87 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  32.67 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  34.88 
 
 
370 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  38.46 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>