More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2672 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
346 aa  671    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.74 
 
 
348 aa  360  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.62 
 
 
360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.81 
 
 
342 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.49 
 
 
347 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00146165  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.92 
 
 
363 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.901317  normal  0.0679458 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.39 
 
 
365 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18641  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.39 
 
 
365 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0124034  normal  0.0867755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.97 
 
 
352 aa  334  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65 
 
 
363 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.959373 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.86 
 
 
365 aa  332  8e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.657095  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.7 
 
 
331 aa  331  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.02 
 
 
363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.638266 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.29 
 
 
345 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.29 
 
 
345 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0470416  normal  0.49714 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1758  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  59.41 
 
 
364 aa  318  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal  0.0158469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2517  putative alkanesulfonate ABC transporter, permease protein  58.01 
 
 
334 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2163  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  58.05 
 
 
353 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.06 
 
 
331 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.478821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4900  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.72 
 
 
333 aa  309  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572728  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0115  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  59.45 
 
 
352 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.32 
 
 
332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal  0.348688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31120  ABC transporter permease protein  68.12 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.848336  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.93 
 
 
332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.811206  normal  0.0956624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4838  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.93 
 
 
334 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5618  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.2 
 
 
351 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447889  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2515  putative alkanesulfonate ABC transporter, permease protein  49.7 
 
 
337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.83 
 
 
331 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.124749  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.5 
 
 
332 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.49 
 
 
340 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
355 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.17 
 
 
310 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.39 
 
 
302 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
277 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0213  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 
252 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
283 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
277 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
277 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  31.2 
 
 
252 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.14 
 
 
261 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.49 
 
 
266 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  31.58 
 
 
260 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
314 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.47 
 
 
290 aa  99.8  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.51 
 
 
273 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.51 
 
 
273 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.28 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1238  nitrate transport permease  26.78 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2146  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.63 
 
 
315 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  32.16 
 
 
269 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  31.36 
 
 
274 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.05 
 
 
279 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0924  ABC transporter permease protein  28.24 
 
 
258 aa  96.7  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  29.44 
 
 
297 aa  96.3  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3160  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.4 
 
 
274 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.913146  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
273 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  30.93 
 
 
274 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.5 
 
 
271 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
287 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.52 
 
 
255 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  27.94 
 
 
273 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3523  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.9 
 
 
309 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
265 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.01 
 
 
305 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.18 
 
 
306 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13670  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  27.78 
 
 
249 aa  93.2  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  26.72 
 
 
280 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
288 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  27.86 
 
 
305 aa  93.6  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
269 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0874  nitrate transport permease  28.35 
 
 
283 aa  93.2  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00524559 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3750  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  30.82 
 
 
269 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
269 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
260 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.12 
 
 
277 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 
267 aa  92.8  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
273 aa  92.8  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  31.64 
 
 
278 aa  92.4  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  30.32 
 
 
281 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.8 
 
 
279 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  27.59 
 
 
282 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  29.1 
 
 
277 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  29.34 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.35 
 
 
293 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
278 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.51 
 
 
276 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  28.63 
 
 
250 aa  90.5  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3729  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.03 
 
 
280 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0184404  normal  0.11569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.3 
 
 
279 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.54 
 
 
265 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.231998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3675  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.03 
 
 
280 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  28.08 
 
 
272 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7221  ABC transporter membrane spanning protein (nitrate/sulfonates)  31.49 
 
 
282 aa  90.1  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.48 
 
 
275 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 
276 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.936191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>