More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5618 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5618  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
351 aa  675    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447889  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.51 
 
 
360 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.29 
 
 
347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00146165  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.47 
 
 
345 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.47 
 
 
345 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0470416  normal  0.49714 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.85 
 
 
363 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.901317  normal  0.0679458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.58 
 
 
365 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.657095  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.1 
 
 
365 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18641  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.1 
 
 
365 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0124034  normal  0.0867755 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.62 
 
 
363 aa  371  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.638266 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.67 
 
 
363 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.959373 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1758  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  64.81 
 
 
364 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal  0.0158469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.77 
 
 
331 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.478821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31120  ABC transporter permease protein  70 
 
 
331 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.848336  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.73 
 
 
352 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2163  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  62.54 
 
 
353 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0115  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  65.36 
 
 
352 aa  328  9e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.45 
 
 
331 aa  324  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.76 
 
 
342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.51 
 
 
332 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal  0.348688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.94 
 
 
332 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.811206  normal  0.0956624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4900  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.39 
 
 
333 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572728  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.69 
 
 
346 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.15 
 
 
348 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4838  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.33 
 
 
334 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2517  putative alkanesulfonate ABC transporter, permease protein  53.61 
 
 
334 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.51 
 
 
331 aa  264  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.124749  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2515  putative alkanesulfonate ABC transporter, permease protein  50.16 
 
 
337 aa  258  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.2 
 
 
332 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.86 
 
 
338 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
340 aa  206  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
355 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
342 aa  171  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
302 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
283 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0213  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
252 aa  106  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 
250 aa  105  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.14 
 
 
273 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
314 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.31 
 
 
310 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.62 
 
 
267 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
277 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
277 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
288 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
255 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
280 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
295 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  33.33 
 
 
269 aa  99.8  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1238  nitrate transport permease  26.84 
 
 
279 aa  99.8  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
272 aa  99.4  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0102858  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  32.78 
 
 
260 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.25 
 
 
281 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.63 
 
 
266 aa  97.1  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  30.08 
 
 
252 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
302 aa  96.7  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.31 
 
 
305 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.5 
 
 
273 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.05 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
273 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.1 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  30 
 
 
273 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 
273 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 
273 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  31.29 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  31.66 
 
 
285 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  32.84 
 
 
274 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.37 
 
 
271 aa  93.6  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 
278 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
279 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  31.13 
 
 
277 aa  93.6  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34320  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  33.06 
 
 
273 aa  93.6  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3750  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  33.96 
 
 
269 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
269 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
269 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 
280 aa  92.8  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.19 
 
 
277 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  32.46 
 
 
274 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
273 aa  92.8  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
265 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.26 
 
 
306 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0673  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.31 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0666321  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
279 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
279 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.62 
 
 
283 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  30.57 
 
 
278 aa  90.9  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
269 aa  90.9  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  29.38 
 
 
282 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  28.46 
 
 
286 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27200  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  24.14 
 
 
253 aa  90.5  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
282 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
256 aa  90.1  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.77 
 
 
261 aa  90.1  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  27.85 
 
 
305 aa  89.7  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
319 aa  89.4  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  30.94 
 
 
282 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
291 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  31.05 
 
 
272 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5896  nitrate ABC transporter permease protein  28.57 
 
 
297 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>