More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2517 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2517  putative alkanesulfonate ABC transporter, permease protein  100 
 
 
334 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.69 
 
 
352 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.07 
 
 
342 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.68 
 
 
360 aa  318  9e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.7 
 
 
365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18641  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.7 
 
 
365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0124034  normal  0.0867755 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.06 
 
 
346 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.53 
 
 
332 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal  0.348688 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.3 
 
 
365 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.657095  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.9 
 
 
363 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.901317  normal  0.0679458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.73 
 
 
332 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.811206  normal  0.0956624 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.9 
 
 
363 aa  309  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.959373 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4900  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.93 
 
 
333 aa  309  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572728  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.51 
 
 
363 aa  309  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.638266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31120  ABC transporter permease protein  67.53 
 
 
331 aa  308  9e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.848336  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0115  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  58.39 
 
 
352 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.46 
 
 
348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.44 
 
 
347 aa  302  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00146165  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2163  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  65.71 
 
 
353 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4838  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.81 
 
 
334 aa  298  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.68 
 
 
331 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.478821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1758  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  56.67 
 
 
364 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal  0.0158469 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.12 
 
 
331 aa  295  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.24 
 
 
345 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.24 
 
 
345 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0470416  normal  0.49714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5618  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.19 
 
 
351 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447889  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.97 
 
 
331 aa  272  7e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.124749  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.61 
 
 
332 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2515  putative alkanesulfonate ABC transporter, permease protein  49.2 
 
 
337 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.76 
 
 
338 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
355 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
340 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
342 aa  171  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
277 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  30.5 
 
 
273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
314 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.19 
 
 
271 aa  108  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.83 
 
 
266 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 
277 aa  105  9e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
274 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.11 
 
 
310 aa  102  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 
281 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.13 
 
 
261 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2597  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.02 
 
 
280 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
288 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.73 
 
 
277 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
273 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3520  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.63 
 
 
280 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
273 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.2 
 
 
283 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  31.79 
 
 
269 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0213  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
252 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2819  nitrate transport permease protein (nrtB)  32.92 
 
 
304 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233469  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 
273 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
267 aa  99.4  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0673  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.31 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0666321  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 
273 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.36 
 
 
283 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.96 
 
 
292 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  30.17 
 
 
252 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 
275 aa  96.3  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
283 aa  95.9  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 
250 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
272 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.34 
 
 
281 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  29.96 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  30.91 
 
 
284 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  30.91 
 
 
284 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  30.91 
 
 
284 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.97 
 
 
252 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.87 
 
 
278 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.92 
 
 
287 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  28.12 
 
 
279 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  31.96 
 
 
278 aa  93.6  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3750  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  31.87 
 
 
269 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  31.13 
 
 
274 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
269 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
269 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.22 
 
 
290 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.86 
 
 
255 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  29.09 
 
 
282 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.56 
 
 
279 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  29.09 
 
 
282 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4924  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.1 
 
 
280 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.4 
 
 
279 aa  92.8  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
272 aa  92.4  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0102858  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  30.74 
 
 
274 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  28.38 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
302 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
278 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.65 
 
 
273 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  25.65 
 
 
273 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  30.77 
 
 
279 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
281 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479856  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.28 
 
 
254 aa  91.7  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4879  putative ABC transporter, permease protein  29.88 
 
 
263 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.41 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  30.37 
 
 
273 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>