95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0517 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  596  1e-169  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1342  chromosome partitioning ATPase  64.2 
 
 		 241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.565259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1401  hypothetical protein  50.65 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145922 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  53.51 
 
 		 259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  46.15 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  52.63 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  52.63 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  52.63 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1337  chromosome partitioning ATPase  45.03 
 
 		 226 aa  133  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  48 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  48.84 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  43.17 
 
 		 257 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  46.49 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  47.2 
 
 		 271 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  47.97 
 
 		 244 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  46.15 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  45.45 
 
 		 246 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  44.44 
 
 		 279 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 		 346 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  40.4 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  44.8 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  45.45 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  46.4 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  46.83 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  45.3 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  39.53 
 
 		 246 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  43.2 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  43.22 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  42.74 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  42.4 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 275 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  38.4 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  38.71 
 
 		 253 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  39.6 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0147  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0380838  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0519  hypothetical protein  35.29 
 
 		 259 aa  58.9  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.185936  normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0260  septum site-determining protein MinD  32.67 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.148495  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1334  hypothetical protein  28.3 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0739  hypothetical protein  25.29 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 392 aa  51.2  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  31.67 
 
 		 416 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0150  conserved hypothetical protein  52.73 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  28.93 
 
 		 508 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0914  chromosome partitioning ATPase  35.2 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.800283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  28.95 
 
 		 291 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1341  hypothetical protein  29.92 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  31.67 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  25.97 
 
 		 399 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  25.97 
 
 		 399 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5095  arsenite-activated ATPase ArsA  41.94 
 
 		 729 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  31.2 
 
 		 365 aa  46.2  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3664  arsenite-activated ATPase (arsA)  31.3 
 
 		 589 aa  45.8  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2546  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.67 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  27.14 
 
 		 408 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1592  hypothetical protein  24.65 
 
 		 150 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0145604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  31.41 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1550  septum site-determining protein MinD  33.99 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.300295  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0234  hypothetical protein  43.08 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.168768 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1491  arsenite-activated ATPase (arsA)  45.1 
 
 		 587 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.738172  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  24.56 
 
 		 878 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2139  arsenite-activated ATPase ArsA  45.1 
 
 		 587 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  24.56 
 
 		 878 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  31.06 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 		 344 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_011735  BbuZS7_X32  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  29.13 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0000524469  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3445  arsenite-activated ATPase ArsA  31.06 
 
 		 640 aa  43.5  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  33.61 
 
 		 764 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2637  anion-transporting ATPase  30.2 
 
 		 590 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.473292  normal  0.577432 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.78 
 
 		 471 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_011785  BbuZS7_I17  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  61.76 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.461136  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  27.04 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.08 
 
 		 408 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2835  ATPase  40 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3342  arsenite-activated ATPase ArsA  28.68 
 
 		 643 aa  43.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2521  Mrp protein  40 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  29.63 
 
 		 298 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  27.67 
 
 		 290 aa  42.7  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  32.43 
 
 		 368 aa  42.7  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1450  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.06 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000235787  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  31.65 
 
 		 278 aa  42.7  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.24 
 
 		 265 aa  42.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.99 
 
 		 274 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  29.33 
 
 		 364 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  29.68 
 
 		 285 aa  42.4  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0956  chromosome partitioning ATPase  45 
 
 		 256 aa  42.4  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0593249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 		 402 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>