144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1716 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
371 aa  750    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  50.4 
 
 
374 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  37.2 
 
 
370 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  36.1 
 
 
344 aa  210  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  34.58 
 
 
508 aa  122  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  31.72 
 
 
255 aa  90.1  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 
253 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 
253 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  29.31 
 
 
263 aa  84  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  31 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  28.12 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  31.63 
 
 
878 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  31.16 
 
 
878 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  27.63 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  30.84 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  28.16 
 
 
393 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 
247 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  29.05 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  29.03 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  29.03 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  26.39 
 
 
884 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  26.83 
 
 
508 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0320  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
388 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2086  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 
394 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  29.05 
 
 
387 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  25.54 
 
 
246 aa  63.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0614  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  25.75 
 
 
271 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  27.78 
 
 
406 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 
387 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  27.44 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  28.18 
 
 
397 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  24.78 
 
 
257 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 
396 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  27.12 
 
 
261 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0503  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 
401 aa  60.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0527629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  27.43 
 
 
253 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 
346 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  23.14 
 
 
257 aa  60.1  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  27.4 
 
 
395 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  27.4 
 
 
396 aa  59.7  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  26.99 
 
 
396 aa  59.7  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 
404 aa  59.7  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  27.31 
 
 
406 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  28.08 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  26.28 
 
 
407 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  25.93 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
266 aa  58.9  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  23.68 
 
 
263 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  26.69 
 
 
261 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 
387 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 
387 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06350  uncharacterized flavoprotein  23.67 
 
 
420 aa  57  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.882044  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  23.93 
 
 
257 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  26.18 
 
 
261 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
398 aa  56.6  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2889  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 
410 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.726482  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  26.55 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.19 
 
 
504 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.61 
 
 
479 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 
479 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.61 
 
 
479 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  26.86 
 
 
263 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  26.25 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  27.37 
 
 
378 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  26.86 
 
 
263 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  26.61 
 
 
479 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.61 
 
 
479 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.61 
 
 
479 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.91 
 
 
479 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.61 
 
 
479 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.61 
 
 
479 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.61 
 
 
479 aa  54.7  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.91 
 
 
479 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.91 
 
 
479 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 
393 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 
392 aa  53.9  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1920  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
393 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.91 
 
 
479 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.91 
 
 
479 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 
209 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  26.94 
 
 
404 aa  53.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  29.89 
 
 
211 aa  52.8  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
407 aa  52.8  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.43 
 
 
394 aa  52.8  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 
396 aa  52.8  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
402 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  27.83 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.44 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 
275 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  23.63 
 
 
253 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>