More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0234 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0234  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  571  1.0000000000000001e-162  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.168768 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0956  chromosome partitioning ATPase  52.02 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0593249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0950  hypothetical protein  40.33 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.208772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0985  hypothetical protein  35.54 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.126225 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1341  hypothetical protein  34.36 
 
 		 266 aa  158  9e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0519  hypothetical protein  33.59 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.185936  normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0404  hypothetical protein  30.52 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2249  conserved hypothetical protein  26.77 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0453  hypothetical protein  22.8 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1344  hypothetical protein  22.16 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1343  hypothetical protein  49.15 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.43391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1342  chromosome partitioning ATPase  27.38 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.565259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1450  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.06 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000235787  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5618  flagellar biosynthesis protein FlhG  40 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81162  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  43.24 
 
 		 370 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1365  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.35 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.625193  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.61 
 
 		 410 aa  50.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.07 
 
 		 317 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  40.79 
 
 		 365 aa  50.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38000  chromosome segregation ATPase  46.55 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.54 
 
 		 260 aa  50.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  42.62 
 
 		 330 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.71 
 
 		 209 aa  49.7  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  48.28 
 
 		 348 aa  49.3  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  40 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  48.98 
 
 		 259 aa  48.9  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48 
 
 		 260 aa  48.9  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.98 
 
 		 289 aa  48.9  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  47.06 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1646  mrp protein  32.37 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.15 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0141  ATP-binding protein; Mrp protein  38.1 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000822787  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2552  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.81 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000741999  normal  0.352702 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  40.79 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.81 
 
 		 470 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15350  chromosome partitioning ATPase  45.9 
 
 		 382 aa  48.1  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.65 
 
 		 336 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3671  mrp protein  34.58 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3578  mrp protein  41.1 
 
 		 349 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.68 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0144  ATPase-like, ParA/MinD  51.11 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  43.75 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  43.75 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3571  mrp protein  53.66 
 
 		 349 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.983945 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2598  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.18 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  43.75 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416241 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0145  conserved hypothetical protein  22.27 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.199985  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0303  conserved hypothetical protein  27.48 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1337  chromosome partitioning ATPase  45.16 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.86 
 
 		 339 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  45.61 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0148  chromosome partitioning ATPase  46.15 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0375765  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  56.41 
 
 		 373 aa  47  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.5 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1940  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.46 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403217  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.17 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4218  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.28 
 
 		 452 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  32.06 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3357  mrp protein  53.66 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.330315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3321  ATP-binding mrp protein  53.66 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3271  ATP-binding mrp protein  53.66 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.13 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3620  mrp protein  53.66 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  48.94 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1408  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.74 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.391626 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0147  mrp protein  38.1 
 
 		 354 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0142  ATP-binding protein; Mrp protein  38.1 
 
 		 354 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0147  mrp protein  38.1 
 
 		 354 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3588  mrp protein  53.66 
 
 		 349 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.15 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0160  mrp protein  38.1 
 
 		 354 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.751e-23 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.15 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.94 
 
 		 362 aa  46.6  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.05 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.19 
 
 		 392 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4507  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.44 
 
 		 462 aa  46.2  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.013089 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.62 
 
 		 346 aa  46.2  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.28 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  47.17 
 
 		 358 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  44.9 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.33 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4933  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.51 
 
 		 355 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295816  normal  0.267095 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.16 
 
 		 294 aa  45.8  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  51.06 
 
 		 280 aa  45.8  0.0008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 		 253 aa  45.8  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  51.06 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  48.94 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  58.33 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  48.15 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.83 
 
 		 437 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  48.94 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0552  septum site-determining protein MinD  56.76 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  51.06 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11254  hypothetical protein  47.5 
 
 		 390 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.397293  hitchhiker  0.00931027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.49 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2205  hypothetical protein  50 
 
 		 375 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>