11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0985 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0985  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  497  1e-140  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.126225 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0234  hypothetical protein  35.54 
 
 
285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.168768 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0519  hypothetical protein  36.29 
 
 
259 aa  150  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.185936  normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0956  chromosome partitioning ATPase  31.17 
 
 
256 aa  130  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0593249  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1341  hypothetical protein  34.03 
 
 
266 aa  129  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0404  hypothetical protein  33.64 
 
 
244 aa  115  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0950  hypothetical protein  29.86 
 
 
251 aa  102  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.208772  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1344  hypothetical protein  29.19 
 
 
197 aa  82  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0453  hypothetical protein  24.78 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2249  conserved hypothetical protein  22.63 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5618  flagellar biosynthesis protein FlhG  51.16 
 
 
264 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>