67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0453 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0453  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  502  1e-141  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0519  hypothetical protein  30.2 
 
 		 259 aa  89.7  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.185936  normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1341  hypothetical protein  30 
 
 		 266 aa  85.1  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0956  chromosome partitioning ATPase  23.6 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0593249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0985  hypothetical protein  24.78 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.126225 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0234  hypothetical protein  22.8 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.168768 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0950  hypothetical protein  24.69 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.208772  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0145  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.199985  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0404  hypothetical protein  27.71 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B12  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  27.82 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.042281  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1365  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.54 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.625193  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.46 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1273  MRP family ATP-binding protein  45.45 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0109668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.4 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  27.59 
 
 		 330 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.4 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55 
 
 		 349 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.98 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.72 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.28 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1343  hypothetical protein  40.38 
 
 		 81 aa  45.8  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.43391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.74 
 
 		 238 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.43 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 		 392 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0704  chromosome partitioning protein  44.9 
 
 		 224 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  24 
 
 		 789 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8771  chromosome partitioning ATPase  30.11 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.03 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.68 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2552  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.11 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000741999  normal  0.352702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2605  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.62 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.47 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  27.27 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  66.67 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2478  chromosome partitioning ATPase  25.44 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.61 
 
 		 397 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.7 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.99 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.07 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.99 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  29.51 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 		 339 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.43 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.43 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.43 
 
 		 212 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.43 
 
 		 212 aa  42.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4907  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.62 
 
 		 290 aa  42.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.43 
 
 		 212 aa  42.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0076  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.43 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.07 
 
 		 212 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4507  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.3 
 
 		 462 aa  42.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.013089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  39.13 
 
 		 460 aa  42.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  34.43 
 
 		 212 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3145  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.5 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46037  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.85 
 
 		 274 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  33.82 
 
 		 213 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0779  chromosome partitioning ATPase  28.57 
 
 		 431 aa  42  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000669652  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.72 
 
 		 249 aa  42  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.43 
 
 		 212 aa  42  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  33.82 
 
 		 213 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  37.29 
 
 		 222 aa  42  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  35.8 
 
 		 361 aa  42  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.46 
 
 		 264 aa  42  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.92 
 
 		 222 aa  42  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.43 
 
 		 212 aa  42  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.4 
 
 		 212 aa  42  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  34.43 
 
 		 212 aa  42  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>