257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0950 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0950  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  509  1e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.208772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0956  chromosome partitioning ATPase  51.59 
 
 		 256 aa  261  6.999999999999999e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0593249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0234  hypothetical protein  40.33 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.168768 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1341  hypothetical protein  34.15 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0519  hypothetical protein  31.89 
 
 		 259 aa  108  7.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.185936  normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0985  hypothetical protein  29.86 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.126225 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0404  hypothetical protein  31.09 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1344  hypothetical protein  27.18 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0453  hypothetical protein  24.69 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  33.86 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2249  conserved hypothetical protein  25.52 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0021  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.75 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0021  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.75 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472925  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  31.78 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  34.15 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.78 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  31.78 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  31.5 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  30.08 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.16 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.37 
 
 		 262 aa  52  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1343  hypothetical protein  52.08 
 
 		 81 aa  52  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.43391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  29.85 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  31.75 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  31.75 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  30.37 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.35 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  28.35 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.01 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.01 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4907  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.81 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.71 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.35 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  31.16 
 
 		 397 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.35 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  28.35 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  28.35 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.35 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.53 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  30.53 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0118  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  28.35 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.07 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  30 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  31.01 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.99 
 
 		 383 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.34 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  32.31 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3835  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.8 
 
 		 316 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10007  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3898  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.47 
 
 		 316 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475891  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.69 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.03 
 
 		 263 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 		 270 aa  48.5  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5116  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 278 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  28.46 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0113  chromosome segregation ATPase  26.98 
 
 		 256 aa  48.9  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2886  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.27 
 
 		 264 aa  48.5  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0076  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3976  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.47 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0294413  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.21 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.77 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.21 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.97066  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.2 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.06 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.8 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  30 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 		 317 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.39 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  30.66 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.56 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  27.91 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.23 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.56 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  30.66 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.95 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.46 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.35 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.5 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.46 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.23 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.71 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.46 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.69 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.6 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.41 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  50 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  27.39 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.63 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  29.6 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000176763 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  26.34 
 
 		 756 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  33.59 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 		 453 aa  47  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  43.55 
 
 		 365 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>