293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0956 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0956  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
256 aa  525  1e-148  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0593249  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0234  hypothetical protein  52.02 
 
 
285 aa  274  9e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.168768 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0950  hypothetical protein  51.59 
 
 
251 aa  261  6.999999999999999e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.208772  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1341  hypothetical protein  33.85 
 
 
266 aa  151  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0519  hypothetical protein  34.47 
 
 
259 aa  138  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.185936  normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0985  hypothetical protein  31.17 
 
 
245 aa  130  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.126225 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0404  hypothetical protein  31.17 
 
 
244 aa  118  9e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2249  conserved hypothetical protein  28.06 
 
 
247 aa  86.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0453  hypothetical protein  23.6 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1344  hypothetical protein  29.35 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1343  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  55.5  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.43391  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1401  hypothetical protein  28.57 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5765  hypothetical protein  44.26 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  44.26 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.26 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.32 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0396  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.26 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1450  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.62 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000235787  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0118  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.15 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5070  ParA family protein  42.62 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1765  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  41.25 
 
 
355 aa  49.3  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.608782  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5120  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.62 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888866  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4943  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.62 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.69 
 
 
260 aa  49.7  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.57 
 
 
253 aa  48.9  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5090  ParA family protein  32.77 
 
 
259 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  50.91 
 
 
359 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  54.76 
 
 
272 aa  48.9  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  50 
 
 
253 aa  48.9  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.98 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.26 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3340  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.55 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3145  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.09 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46037  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4507  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.44 
 
 
462 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013089 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  45.1 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0440  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.98 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4218  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.81 
 
 
452 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2197  chromosome partitioning ATPase  56.1 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.04216  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2235  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  56.1 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0694102  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  48 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45160  hypothetical protein  42.62 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1337  chromosome partitioning ATPase  35.05 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1365  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.35 
 
 
272 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.625193  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3343  hypothetical protein  48 
 
 
369 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408493  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6366  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.67 
 
 
274 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0439498  normal  0.30299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  50 
 
 
357 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.37 
 
 
739 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.08 
 
 
274 aa  46.2  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  45.83 
 
 
330 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.1 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  31.53 
 
 
363 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0145  conserved hypothetical protein  22.22 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.199985  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4907  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.92 
 
 
290 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0076  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.74 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.81 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.85 
 
 
367 aa  46.2  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.55 
 
 
249 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1320  chromosome segregation ATPase  39.66 
 
 
259 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.23 
 
 
255 aa  45.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0468  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.23 
 
 
254 aa  45.8  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.08 
 
 
210 aa  45.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  56.41 
 
 
358 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1058  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.66 
 
 
259 aa  45.8  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.62 
 
 
259 aa  45.8  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  50 
 
 
365 aa  45.8  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.66 
 
 
264 aa  45.8  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  44.68 
 
 
263 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  53.85 
 
 
286 aa  45.4  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  37.93 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.85 
 
 
362 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3357  mrp protein  51.22 
 
 
349 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.330315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3321  ATP-binding mrp protein  51.22 
 
 
349 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3271  ATP-binding mrp protein  51.22 
 
 
349 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  43.75 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1153  ATPase  46.94 
 
 
361 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  23.22 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  51.28 
 
 
367 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.93 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  48 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0748  MinD family ATPase  43.48 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6104  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.75 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3620  mrp protein  51.22 
 
 
349 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3887  ATPase-like, ParA/MinD  47.5 
 
 
379 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.803314  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  51.28 
 
 
367 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20271  hypothetical protein  46.94 
 
 
367 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  48.98 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  53.85 
 
 
362 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  45.83 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3588  mrp protein  51.22 
 
 
349 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  48.94 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.9 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  26.74 
 
 
490 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48 
 
 
362 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6545  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.89 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952996  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.53 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0508  chromosome partitioning ATPase protein  45 
 
 
390 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.29 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>