More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0748 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0748  MinD family ATPase  100 
 
 
292 aa  597  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.85 
 
 
287 aa  311  9e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.77 
 
 
284 aa  292  5e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.200567  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1234  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.87 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375656  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1954  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.28 
 
 
285 aa  278  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.89 
 
 
293 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1585  MinD family ATPase  47.67 
 
 
282 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.13 
 
 
288 aa  276  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00176124  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2427  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.07 
 
 
283 aa  264  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0195  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.15 
 
 
288 aa  261  6.999999999999999e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.49 
 
 
283 aa  260  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.55 
 
 
293 aa  256  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0658  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.29 
 
 
282 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.77 
 
 
282 aa  255  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0617  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.29 
 
 
284 aa  255  7e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000727568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1831  hypothetical protein  47.14 
 
 
285 aa  251  7e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.71 
 
 
278 aa  251  8.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.83 
 
 
652 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0462  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.76 
 
 
285 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.26 
 
 
285 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.02 
 
 
287 aa  249  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.76 
 
 
282 aa  248  8e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2222  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.68 
 
 
276 aa  248  9e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.76 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  48.86 
 
 
280 aa  242  6e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0565  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.52 
 
 
277 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.21 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.92 
 
 
289 aa  239  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.526028  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0442  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.16 
 
 
290 aa  239  5e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.53 
 
 
283 aa  237  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  43.48 
 
 
311 aa  231  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.33 
 
 
351 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.76 
 
 
301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0340  hypothetical protein  43.63 
 
 
268 aa  222  7e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00338872  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.56 
 
 
292 aa  163  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3201  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  32.99 
 
 
308 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.81 
 
 
286 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.458285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18370  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.7 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0441  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.07 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1233  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.09 
 
 
286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1830  hypothetical protein  33.46 
 
 
310 aa  145  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.705168  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0615  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.66 
 
 
290 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.89 
 
 
292 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  33.46 
 
 
293 aa  142  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0826  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.92 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.69 
 
 
290 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.87 
 
 
296 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1984  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.09 
 
 
287 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.57 
 
 
282 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1445  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.8 
 
 
282 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.121455 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2426  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.06 
 
 
289 aa  135  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0657  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.82 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145251  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.53 
 
 
306 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.9 
 
 
289 aa  132  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.2 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.46 
 
 
291 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.01 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000290019  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1529  MinD family protein  31.16 
 
 
288 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00592522  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.1 
 
 
287 aa  125  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.81 
 
 
290 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.95 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0747  MinD family ATPase  31.23 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.31 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.152479  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1588  MinD family ATPase  33.06 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.18 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100498  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2078  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.03 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0564  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.02 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1528  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.18 
 
 
288 aa  116  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.539441  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.8 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.04 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.49 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.92 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.93 
 
 
280 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000859922  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1318  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.61 
 
 
259 aa  60.1  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.29 
 
 
301 aa  59.7  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.94 
 
 
290 aa  59.7  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00471356  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1509  ParaA family ATPase  21.7 
 
 
287 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.33 
 
 
401 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0368  ParaA family ATPase  21.99 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141266  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.47 
 
 
367 aa  56.2  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.02 
 
 
370 aa  55.8  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  28 
 
 
280 aa  55.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  25.08 
 
 
280 aa  55.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.11 
 
 
289 aa  55.8  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  26.2 
 
 
367 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.44 
 
 
400 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  25.76 
 
 
367 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.52 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  21.28 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.59 
 
 
288 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  57.14 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0366  histidinol phosphatase  24.15 
 
 
288 aa  53.5  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00129205  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2129  septum site-determining protein MinD  23.55 
 
 
265 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000239479  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0060  ParaA family ATPase  24.62 
 
 
288 aa  52.8  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0101  ParaA family ATPase  24.62 
 
 
288 aa  52.8  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1296  Mrp protein  54.76 
 
 
359 aa  52.8  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.27319  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  25.45 
 
 
358 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0704  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.48 
 
 
291 aa  52.4  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17681  hypothetical protein  25.23 
 
 
355 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.400744  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0395  cell division ATPase MinD  23.56 
 
 
262 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>