More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1529 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1529  MinD family protein  100 
 
 
288 aa  590  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00592522  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0615  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.44 
 
 
290 aa  233  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.64 
 
 
292 aa  230  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40 
 
 
291 aa  229  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000290019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1233  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.12 
 
 
286 aa  228  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1830  hypothetical protein  41.22 
 
 
310 aa  226  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.705168  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.14 
 
 
291 aa  226  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0657  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.71 
 
 
286 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145251  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.98 
 
 
292 aa  222  7e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.59 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18370  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.44 
 
 
288 aa  216  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.98 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.152479  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.29 
 
 
290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.85 
 
 
305 aa  209  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3201  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  36.99 
 
 
308 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39 
 
 
287 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.98 
 
 
292 aa  206  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.86 
 
 
306 aa  205  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0747  MinD family ATPase  39.56 
 
 
299 aa  205  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0564  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.23 
 
 
286 aa  204  9e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1445  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.45 
 
 
282 aa  202  4e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.121455 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1588  MinD family ATPase  36.9 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1984  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.48 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.85 
 
 
282 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1528  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.7 
 
 
288 aa  196  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.539441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.64 
 
 
652 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  39.11 
 
 
293 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.78 
 
 
282 aa  195  9e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0441  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.69 
 
 
285 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2426  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.62 
 
 
289 aa  193  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.13 
 
 
267 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100498  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.64 
 
 
289 aa  186  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2078  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.12 
 
 
275 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.82 
 
 
296 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.95 
 
 
280 aa  172  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000859922  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.64 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.95 
 
 
288 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0748  MinD family ATPase  31.16 
 
 
292 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.35 
 
 
289 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.526028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.21 
 
 
287 aa  126  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.36 
 
 
282 aa  126  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.11 
 
 
293 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 
284 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.200567  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0565  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 
277 aa  122  9e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0462  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.71 
 
 
285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.97 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.97 
 
 
285 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  30.03 
 
 
280 aa  115  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.56 
 
 
351 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0617  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.02 
 
 
284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000727568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.19 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.18 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0195  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.3 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.42 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2222  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.99 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.37 
 
 
287 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.4 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1831  hypothetical protein  30.24 
 
 
285 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1234  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.15 
 
 
281 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375656  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.36 
 
 
278 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1954  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.07 
 
 
285 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0442  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.87 
 
 
290 aa  102  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  27.24 
 
 
311 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0658  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.82 
 
 
282 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.06 
 
 
283 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.36 
 
 
286 aa  97.4  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.458285  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1585  MinD family ATPase  26.8 
 
 
282 aa  96.3  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.14 
 
 
293 aa  95.9  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2427  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.96 
 
 
283 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.71 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.69 
 
 
288 aa  90.1  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00176124  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0340  hypothetical protein  29.2 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00338872  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0826  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.03 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  30.77 
 
 
390 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2393  2-oxoacid:acceptor oxidoreductase, delta subunit, pyruvate/2-ketoisovalerate  42.86 
 
 
87 aa  53.9  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.779105 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  42.86 
 
 
381 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1695  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.77 
 
 
113 aa  53.1  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0919  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
281 aa  52.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3864  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.62 
 
 
358 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0345695 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2321  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  40.82 
 
 
81 aa  50.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2063  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 
385 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000008917  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2589  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  43.64 
 
 
792 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12991  ferredoxin  38.46 
 
 
341 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.165246 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0781  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40 
 
 
623 aa  49.7  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2341  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32 
 
 
232 aa  49.3  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0747882  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0775  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.35 
 
 
592 aa  49.3  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291818  hitchhiker  0.00672814 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2719  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  42 
 
 
81 aa  49.3  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1425  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  36.84 
 
 
810 aa  49.3  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0494363  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0202  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  44.9 
 
 
86 aa  49.3  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2170  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  29.63 
 
 
221 aa  49.3  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.211409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0273  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.98 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1930  ferredoxin  43.64 
 
 
316 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1047  ferredoxin  41.82 
 
 
248 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1337  ferredoxin  43.64 
 
 
316 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0800  hypothetical protein  36.67 
 
 
324 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1447  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.99 
 
 
1012 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1015  ferredoxin  43.64 
 
 
279 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0219422  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.99 
 
 
1012 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2150  septum site-determining protein MinD  22.22 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174777  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0014  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.85 
 
 
1116 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.952368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>