More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2426 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2426  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
289 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  56.94 
 
 
293 aa  324  1e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.65 
 
 
289 aa  278  7e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1233  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.87 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3201  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  45.33 
 
 
308 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0441  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.25 
 
 
285 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0615  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.77 
 
 
290 aa  239  5e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176435  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0564  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.01 
 
 
286 aa  235  7e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1830  hypothetical protein  45.38 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.705168  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.69 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1984  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.36 
 
 
287 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.72 
 
 
282 aa  232  5e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18370  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.08 
 
 
288 aa  232  7.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0657  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.3 
 
 
286 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.89 
 
 
292 aa  232  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.87 
 
 
292 aa  230  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.6 
 
 
287 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.72 
 
 
282 aa  228  8e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.28 
 
 
291 aa  227  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000290019  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1445  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.02 
 
 
282 aa  226  4e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.121455 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1588  MinD family ATPase  41.52 
 
 
291 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.63 
 
 
267 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.91 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.57 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.152479  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.38 
 
 
290 aa  219  5e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.41 
 
 
291 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.13 
 
 
292 aa  215  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2078  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.7 
 
 
275 aa  212  7e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.07 
 
 
306 aa  208  8e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.7 
 
 
652 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0747  MinD family ATPase  40.47 
 
 
299 aa  201  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.81 
 
 
280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000859922  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.53 
 
 
296 aa  199  5e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1529  MinD family protein  35.62 
 
 
288 aa  193  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00592522  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1528  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.14 
 
 
288 aa  192  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.539441  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.29 
 
 
288 aa  159  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0658  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.6 
 
 
282 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.44 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0195  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.26 
 
 
288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.62 
 
 
283 aa  139  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0617  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.57 
 
 
284 aa  139  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000727568  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.09 
 
 
293 aa  139  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.6 
 
 
292 aa  139  7.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.6 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00176124  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2427  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.17 
 
 
283 aa  136  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0748  MinD family ATPase  32.06 
 
 
292 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1954  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.75 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.6 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.58 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.29 
 
 
287 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1234  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.18 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375656  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.14 
 
 
278 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  32.5 
 
 
311 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.83 
 
 
301 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1585  MinD family ATPase  32.98 
 
 
282 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.79 
 
 
293 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.92 
 
 
282 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.6 
 
 
289 aa  126  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.526028  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.85 
 
 
285 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0462  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.85 
 
 
285 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.85 
 
 
284 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.200567  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1831  hypothetical protein  33.33 
 
 
285 aa  122  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2222  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.45 
 
 
276 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.51 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0565  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.23 
 
 
277 aa  112  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  31.56 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0442  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.61 
 
 
290 aa  109  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.9 
 
 
351 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0340  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00338872  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.87 
 
 
291 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.2 
 
 
286 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.458285  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 
292 aa  94  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0826  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.47 
 
 
286 aa  86.7  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1425  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  45.45 
 
 
810 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0494363  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0850  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.91 
 
 
660 aa  56.2  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  38.03 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1001  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.74 
 
 
656 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0909  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.74 
 
 
657 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14190  septum site-determining protein MinD  30.83 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000320626  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2100  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.78 
 
 
653 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524548  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2589  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  42.59 
 
 
792 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  28.16 
 
 
285 aa  52.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1528  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  43.33 
 
 
89 aa  52  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.44 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.43 
 
 
392 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000007278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  41.54 
 
 
381 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  38.98 
 
 
390 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  38.6 
 
 
502 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.54 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2786  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  36.49 
 
 
612 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0890534  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.64 
 
 
355 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000413474  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  30.77 
 
 
223 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.64 
 
 
361 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  29.75 
 
 
213 aa  50.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2393  2-oxoacid:acceptor oxidoreductase, delta subunit, pyruvate/2-ketoisovalerate  44.23 
 
 
87 aa  50.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.779105 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  28.86 
 
 
291 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2370  septum site-determining protein MinD  30.23 
 
 
260 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0304422  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  32.31 
 
 
265 aa  50.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07270  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  39.06 
 
 
144 aa  50.1  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.194831  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2225  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.28 
 
 
119 aa  49.7  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>