164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0195 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0195  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
288 aa  594  1e-169  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0748  MinD family ATPase  48.15 
 
 
292 aa  261  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0617  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.26 
 
 
284 aa  247  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000727568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1831  hypothetical protein  43.94 
 
 
285 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.22 
 
 
284 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.200567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.78 
 
 
288 aa  239  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00176124  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1234  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.11 
 
 
281 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375656  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.31 
 
 
283 aa  233  3e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.78 
 
 
278 aa  231  8.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0658  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.01 
 
 
282 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.7 
 
 
282 aa  229  5e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.78 
 
 
293 aa  226  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  41.05 
 
 
280 aa  227  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1954  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.59 
 
 
285 aa  226  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.16 
 
 
287 aa  225  8e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.75 
 
 
282 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.31 
 
 
293 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1585  MinD family ATPase  42.22 
 
 
282 aa  219  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  40.33 
 
 
311 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0442  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.36 
 
 
290 aa  216  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2427  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.52 
 
 
283 aa  209  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.02 
 
 
285 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.71 
 
 
652 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.86 
 
 
287 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0462  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.51 
 
 
285 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.78 
 
 
289 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.526028  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.81 
 
 
285 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.49 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.5 
 
 
283 aa  198  9e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0565  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.94 
 
 
277 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.45 
 
 
291 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2222  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.45 
 
 
276 aa  185  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0340  hypothetical protein  39.06 
 
 
268 aa  179  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00338872  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.22 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  37.2 
 
 
293 aa  161  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.31 
 
 
286 aa  158  8e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.458285  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.25 
 
 
290 aa  153  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18370  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.99 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1830  hypothetical protein  33.46 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.705168  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2426  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.26 
 
 
289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0826  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.26 
 
 
286 aa  137  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1445  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
282 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.121455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1984  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.6 
 
 
287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3201  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  30.18 
 
 
308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1233  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.5 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.42 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0615  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.41 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176435  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.53 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.73 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.15 
 
 
292 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.5 
 
 
292 aa  124  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.87 
 
 
291 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000290019  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.82 
 
 
288 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0657  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 
286 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145251  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1528  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.47 
 
 
288 aa  122  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.539441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.36 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100498  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.25 
 
 
287 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0441  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.54 
 
 
285 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.26 
 
 
291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.83 
 
 
287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.152479  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.2 
 
 
289 aa  118  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.97 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1529  MinD family protein  27.3 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00592522  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.02 
 
 
290 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.76 
 
 
306 aa  112  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0564  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.5 
 
 
286 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.66 
 
 
280 aa  102  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000859922  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2078  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.83 
 
 
275 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.07 
 
 
292 aa  98.6  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.13 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.06 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0747  MinD family ATPase  29.23 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1588  MinD family ATPase  27.5 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.91 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.67 
 
 
270 aa  60.1  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2506  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.44 
 
 
272 aa  52.8  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011782  BbuZS7_C15  CdsM  40 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.257297  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  40 
 
 
379 aa  48.9  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2721  hypothetical protein  29.9 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504995  decreased coverage  0.0000694638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  31.4 
 
 
398 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4923  radical SAM domain protein  29.82 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0282  hypothetical protein  23.71 
 
 
246 aa  47.4  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00050925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4977  radical SAM domain-containing protein  29.82 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.258865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  66.67 
 
 
407 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4921  pyruvate formate lyase activating enzyme  31.03 
 
 
287 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0467  cell division ATPase MinD  23.85 
 
 
262 aa  47  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.543355  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4819  pyruvate formate lyase activating enzyme  31.03 
 
 
287 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4973  pyruvate formate lyase activating enzyme  31.03 
 
 
287 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4886  pyruvate formate lyase activating enzyme  31.03 
 
 
287 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0614153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4980  pyruvate formate lyase activating enzyme  31.03 
 
 
287 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4927  radical SAM domain-containing protein  28.95 
 
 
287 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1278  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.83 
 
 
228 aa  46.2  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000199132  normal  0.43012 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.75 
 
 
503 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  29.03 
 
 
502 aa  45.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  31.15 
 
 
505 aa  46.2  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3677  radical SAM domain-containing protein  28.95 
 
 
287 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.005025 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  30.26 
 
 
379 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0739  hypothetical protein  32.29 
 
 
279 aa  45.8  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.45 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.69 
 
 
510 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>