More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1089 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
278 aa  557  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.87 
 
 
288 aa  305  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00176124  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1234  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.65 
 
 
281 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375656  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.64 
 
 
284 aa  289  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.200567  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0617  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.08 
 
 
284 aa  286  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000727568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.03 
 
 
287 aa  277  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0658  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.31 
 
 
282 aa  275  6e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1831  hypothetical protein  47.64 
 
 
285 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.16 
 
 
287 aa  263  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1585  MinD family ATPase  46.38 
 
 
282 aa  260  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.26 
 
 
293 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1954  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.25 
 
 
285 aa  256  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0748  MinD family ATPase  45.71 
 
 
292 aa  251  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.62 
 
 
282 aa  248  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.09 
 
 
293 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2222  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.36 
 
 
276 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0565  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.4 
 
 
277 aa  237  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.67 
 
 
283 aa  235  7e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0195  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.78 
 
 
288 aa  231  8.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.34 
 
 
291 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  42.6 
 
 
280 aa  230  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.21 
 
 
282 aa  230  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.57 
 
 
289 aa  226  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.526028  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0462  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.32 
 
 
285 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.32 
 
 
285 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.2 
 
 
301 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.23 
 
 
285 aa  216  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 
351 aa  215  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.3 
 
 
652 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2427  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.37 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.63 
 
 
283 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0442  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.68 
 
 
290 aa  210  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0340  hypothetical protein  43.68 
 
 
268 aa  206  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00338872  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  39.02 
 
 
311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.03 
 
 
286 aa  177  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.458285  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.57 
 
 
296 aa  157  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  36.54 
 
 
293 aa  157  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.3 
 
 
287 aa  152  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.152479  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1233  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.57 
 
 
286 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 
289 aa  149  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1445  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.63 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.121455 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18370  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.44 
 
 
288 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0615  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.35 
 
 
290 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176435  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.14 
 
 
292 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0826  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.22 
 
 
286 aa  142  5e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.63 
 
 
282 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0564  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.45 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3201  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  30.03 
 
 
308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1830  hypothetical protein  34.78 
 
 
310 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.705168  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.28 
 
 
282 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.95 
 
 
280 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000859922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.1 
 
 
292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1588  MinD family ATPase  32.18 
 
 
291 aa  135  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.66 
 
 
291 aa  135  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000290019  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.12 
 
 
306 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0657  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.14 
 
 
286 aa  131  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145251  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.59 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.05 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2426  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.14 
 
 
289 aa  130  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0441  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.56 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1528  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.21 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.539441  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.04 
 
 
292 aa  126  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.62 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.36 
 
 
290 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.35 
 
 
292 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.1 
 
 
287 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.27 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100498  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2078  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.73 
 
 
275 aa  118  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.07 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0747  MinD family ATPase  30.15 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1984  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.82 
 
 
287 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.62 
 
 
305 aa  116  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1529  MinD family protein  30.36 
 
 
288 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00592522  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  28.57 
 
 
367 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  26.95 
 
 
357 aa  62.4  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  26.87 
 
 
354 aa  61.6  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  28.23 
 
 
367 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  26.71 
 
 
358 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  27.34 
 
 
360 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  26.45 
 
 
357 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1878  NifH/FrxC domain-containing protein  55.56 
 
 
306 aa  60.1  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  25.5 
 
 
363 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  26.98 
 
 
358 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  26 
 
 
356 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  25.42 
 
 
371 aa  57  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  26.1 
 
 
378 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  22.6 
 
 
284 aa  56.6  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1673  MRP protein-like  23.92 
 
 
356 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0087484  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  24.4 
 
 
415 aa  55.8  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  24.38 
 
 
269 aa  55.8  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  26.1 
 
 
375 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17881  hypothetical protein  24.67 
 
 
356 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.804319  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  25.89 
 
 
285 aa  55.8  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  32.22 
 
 
639 aa  55.8  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.21 
 
 
288 aa  55.5  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0909  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.58 
 
 
657 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.36 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  24.58 
 
 
374 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  27.66 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  24.24 
 
 
364 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>