More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0657 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0657  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
286 aa  585  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145251  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1233  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.71 
 
 
286 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.86 
 
 
287 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.152479  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1830  hypothetical protein  46.23 
 
 
310 aa  294  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.705168  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.35 
 
 
292 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.23 
 
 
291 aa  285  5e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0615  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.72 
 
 
290 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.83 
 
 
292 aa  277  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0747  MinD family ATPase  45.42 
 
 
299 aa  275  7e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0564  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.98 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.39 
 
 
287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1588  MinD family ATPase  49.81 
 
 
291 aa  272  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.06 
 
 
305 aa  264  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.86 
 
 
292 aa  260  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3201  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  42.91 
 
 
308 aa  259  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18370  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.2 
 
 
288 aa  257  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.44 
 
 
290 aa  256  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.49 
 
 
652 aa  248  7e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2078  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.98 
 
 
275 aa  246  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0441  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.7 
 
 
285 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.11 
 
 
282 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.05 
 
 
291 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000290019  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2426  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.3 
 
 
289 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.34 
 
 
306 aa  231  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.07 
 
 
280 aa  230  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000859922  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1445  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.14 
 
 
282 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.121455 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.4 
 
 
282 aa  229  5e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  42.76 
 
 
293 aa  229  5e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.83 
 
 
290 aa  225  8e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1984  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.72 
 
 
287 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1529  MinD family protein  42.71 
 
 
288 aa  223  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00592522  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1528  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.93 
 
 
288 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.539441  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.92 
 
 
296 aa  206  4e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.81 
 
 
289 aa  204  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.78 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100498  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.48 
 
 
292 aa  166  4e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.32 
 
 
288 aa  152  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.4 
 
 
282 aa  145  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1234  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.71 
 
 
281 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375656  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.46 
 
 
289 aa  139  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.526028  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 
284 aa  135  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.200567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0748  MinD family ATPase  31.82 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.85 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0658  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1585  MinD family ATPase  31.92 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.93 
 
 
287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.6 
 
 
288 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00176124  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 
283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0617  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.12 
 
 
284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000727568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.92 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1954  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.94 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.45 
 
 
285 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.44 
 
 
283 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0195  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
288 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  30.79 
 
 
280 aa  122  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.69 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  30.58 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0462  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.71 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.57 
 
 
285 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.35 
 
 
351 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0565  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.23 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.81 
 
 
282 aa  115  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2427  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.72 
 
 
283 aa  115  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1831  hypothetical protein  28.68 
 
 
285 aa  112  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0340  hypothetical protein  31.65 
 
 
268 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00338872  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2222  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.23 
 
 
276 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.19 
 
 
291 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.37 
 
 
286 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.458285  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.84 
 
 
301 aa  99  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0826  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.48 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0442  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.69 
 
 
290 aa  92  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.95 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1689  septum site-determining protein (cell division inhibitor)  24.17 
 
 
276 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1688  septum site-determining protein (cell division inhibitor)  24.17 
 
 
276 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.76 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.1 
 
 
260 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0033  septum site-determining protein MinD  22.9 
 
 
272 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67482 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0019  septum site-determining protein MinD  23 
 
 
272 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.324829  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0035  septum site-determining protein MinD  22.67 
 
 
271 aa  56.6  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.253423  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.41 
 
 
260 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1996  cell division inhibitor MinD  21.96 
 
 
270 aa  56.2  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2520  septum site-determining protein MinD  21.89 
 
 
269 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147543  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0868  septum site-determining protein MinD  22.9 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.662974  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2011  cell division inhibitor MinD  21.28 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000962296  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1939  cell division inhibitor MinD  21.28 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2113  septum site-determining protein MinD  21.89 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000128974  normal  0.232041 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2400  cell division inhibitor MinD  21.28 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000176634  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2383  septum site-determining protein MinD  22.9 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000153952  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2122  cell division inhibitor MinD  21.28 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00365598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0008  septum site-determining protein MinD  24 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2370  septum site-determining protein MinD  24.05 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0304422  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2757  cell division inhibitor MinD  21.28 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000621875  hitchhiker  0.001596 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  19.38 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35120  septum site-determining protein MinD  21.48 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.53185  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0125  septum site-determining protein MinD  23.49 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2473  septum site-determining protein MinD  22.02 
 
 
270 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0020932  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1328  cell division inhibitor MinD  22.02 
 
 
270 aa  54.3  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000634164  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1660  cell division inhibitor MinD  22.02 
 
 
270 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000129404  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1633  septum site-determining protein MinD  23.64 
 
 
272 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>