298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1233 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1233  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
286 aa  588  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0657  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.71 
 
 
286 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145251  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.54 
 
 
287 aa  320  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.152479  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.55 
 
 
291 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1830  hypothetical protein  52.06 
 
 
310 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.705168  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0615  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.34 
 
 
290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.49 
 
 
292 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.41 
 
 
292 aa  299  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0441  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.82 
 
 
285 aa  298  6e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1588  MinD family ATPase  49.13 
 
 
291 aa  295  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0564  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.08 
 
 
286 aa  295  9e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.04 
 
 
287 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.45 
 
 
305 aa  286  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0747  MinD family ATPase  46.44 
 
 
299 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3201  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  45.52 
 
 
308 aa  277  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.18 
 
 
290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.92 
 
 
291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000290019  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.82 
 
 
280 aa  262  4e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000859922  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2078  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.51 
 
 
275 aa  261  6e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18370  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.31 
 
 
288 aa  256  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.15 
 
 
292 aa  255  6e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1445  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.26 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.121455 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2426  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.87 
 
 
289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.6 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.56 
 
 
282 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.05 
 
 
652 aa  249  5e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.16 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1984  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.25 
 
 
287 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1528  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.71 
 
 
288 aa  237  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.539441  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  41.87 
 
 
293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.17 
 
 
306 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1529  MinD family protein  46.12 
 
 
288 aa  228  8e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00592522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.01 
 
 
267 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100498  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.74 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.7 
 
 
292 aa  207  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.26 
 
 
296 aa  201  8e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.18 
 
 
287 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.69 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1234  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.98 
 
 
281 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375656  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.57 
 
 
278 aa  152  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.71 
 
 
282 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0748  MinD family ATPase  34.09 
 
 
292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.71 
 
 
288 aa  145  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00176124  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.71 
 
 
289 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.526028  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.96 
 
 
284 aa  142  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.200567  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.48 
 
 
288 aa  142  8e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1831  hypothetical protein  31.25 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0617  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.83 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000727568  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.53 
 
 
283 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.58 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.72 
 
 
301 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1954  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.94 
 
 
285 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0462  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.94 
 
 
285 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1585  MinD family ATPase  30.94 
 
 
282 aa  136  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  32.75 
 
 
311 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.71 
 
 
282 aa  135  8e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0658  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.21 
 
 
282 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.58 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0195  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.5 
 
 
288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.28 
 
 
351 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.46 
 
 
285 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.17 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2222  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.75 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0565  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.39 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.48 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.95 
 
 
291 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2427  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.42 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0442  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.71 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0340  hypothetical protein  33.93 
 
 
268 aa  109  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00338872  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  28.52 
 
 
280 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0826  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.59 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.82 
 
 
286 aa  94  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.458285  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0066  septum site-determining protein MinD  23.18 
 
 
271 aa  57  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0085  septum site-determining protein MinD  23.18 
 
 
271 aa  57  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0035  septum site-determining protein MinD  22.15 
 
 
271 aa  55.8  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.253423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14190  septum site-determining protein MinD  21.03 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000320626  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  21.64 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01150  membrane ATPase of the MinC-MinD-MinE system  24 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2473  septum site-determining protein MinD  24 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0020932  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1957  cell division inhibitor MinD  23.64 
 
 
270 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000405698  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1660  cell division inhibitor MinD  24 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000129404  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1328  cell division inhibitor MinD  24 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000634164  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1777  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.37 
 
 
369 aa  52.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1974  cell division inhibitor MinD  24 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102785  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1275  cell division inhibitor MinD  24 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000562763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1319  cell division inhibitor MinD  24 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000102659  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2014  cell division inhibitor MinD  23.64 
 
 
270 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00470279  normal  0.220645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1318  cell division inhibitor MinD  23.64 
 
 
270 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000703051  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01160  hypothetical protein  24 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2450  cell division inhibitor MinD  24 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00994868  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1954  cell division inhibitor MinD  23.64 
 
 
270 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00226645  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1502  cell division inhibitor MinD  23.64 
 
 
270 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0106864  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3163  septum site-determining protein MinD  22.07 
 
 
265 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2149  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.43 
 
 
1013 aa  52.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3238  septum site-determining protein MinD  23 
 
 
272 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.442677  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2113  septum site-determining protein MinD  23.84 
 
 
269 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000128974  normal  0.232041 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0093  septum site-determining protein MinD  25.76 
 
 
266 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2370  septum site-determining protein MinD  22.14 
 
 
260 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0304422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2445  septum site-determining protein MinD  23.49 
 
 
269 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000350464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>