More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1865 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
306 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.13 
 
 
292 aa  326  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.08 
 
 
290 aa  305  6e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.6 
 
 
291 aa  285  5e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.43 
 
 
292 aa  278  9e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1588  MinD family ATPase  46.23 
 
 
291 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.58 
 
 
305 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0564  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.95 
 
 
286 aa  257  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.27 
 
 
287 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0441  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.49 
 
 
285 aa  251  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1830  hypothetical protein  40.13 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.705168  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.6 
 
 
292 aa  243  3e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0747  MinD family ATPase  43.62 
 
 
299 aa  242  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.44 
 
 
287 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.152479  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0657  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.34 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145251  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1233  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.17 
 
 
286 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3201  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  44.89 
 
 
308 aa  236  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.2 
 
 
652 aa  228  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0615  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.01 
 
 
290 aa  227  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18370  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.07 
 
 
288 aa  226  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.53 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.8 
 
 
280 aa  219  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000859922  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1529  MinD family protein  39.86 
 
 
288 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00592522  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2426  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.07 
 
 
289 aa  210  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.06 
 
 
282 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.24 
 
 
282 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1445  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.36 
 
 
282 aa  206  5e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.121455 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.83 
 
 
290 aa  202  5e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.92 
 
 
291 aa  202  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000290019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.67 
 
 
267 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100498  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  40.36 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.3 
 
 
289 aa  193  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1528  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.85 
 
 
288 aa  193  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.539441  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2078  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.77 
 
 
275 aa  189  7e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1984  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.07 
 
 
287 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.74 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.11 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.08 
 
 
282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.71 
 
 
289 aa  142  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.526028  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 
282 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.47 
 
 
278 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0748  MinD family ATPase  32.53 
 
 
292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.77 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.200567  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.31 
 
 
293 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.15 
 
 
287 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.44 
 
 
287 aa  135  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0462  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.52 
 
 
285 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.38 
 
 
283 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.36 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00176124  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.43 
 
 
285 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.17 
 
 
285 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0617  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.21 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000727568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0658  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 
282 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.1 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1954  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.76 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.07 
 
 
301 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1234  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.72 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375656  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1585  MinD family ATPase  30.97 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  29.23 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.63 
 
 
351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2427  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
283 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  30.58 
 
 
280 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2222  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.66 
 
 
276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0195  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.76 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1831  hypothetical protein  27.46 
 
 
285 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0565  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.76 
 
 
277 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0340  hypothetical protein  28.24 
 
 
268 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00338872  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.47 
 
 
291 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0442  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.89 
 
 
290 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.84 
 
 
293 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.53 
 
 
286 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.458285  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.02 
 
 
292 aa  90.1  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0826  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.98 
 
 
286 aa  85.9  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0396  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.5 
 
 
652 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.599531  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.94 
 
 
399 aa  56.2  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  35.09 
 
 
381 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.4 
 
 
503 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1212  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 
655 aa  50.8  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1139  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.31 
 
 
288 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.079984  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0445  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.93 
 
 
81 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1136  cell division inhibitor  22.6 
 
 
263 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0412072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0919  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.13 
 
 
281 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3195  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.35 
 
 
675 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0391  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.14 
 
 
81 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1318  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.8 
 
 
259 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  31.03 
 
 
503 aa  50.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2441  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.1 
 
 
680 aa  49.7  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  40.68 
 
 
383 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.85 
 
 
257 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0449  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.6 
 
 
665 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222499  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2558  septum site-determining protein MinD  22.15 
 
 
266 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1939  cell division inhibitor MinD  30.37 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2589  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  35.19 
 
 
792 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0165  hypothetical protein  50 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  24.52 
 
 
471 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1552  septum site-determining protein MinD  50 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1586  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.11 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0407218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0413  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.6 
 
 
665 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.295225  normal  0.166033 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3421  ferredoxin  39.22 
 
 
58 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0376  septum site-determining protein MinD  26.32 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>