More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1943 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  100 
 
 
383 aa  776    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  43.09 
 
 
451 aa  292  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  41.69 
 
 
375 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  41.93 
 
 
382 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  40.74 
 
 
375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  41.1 
 
 
376 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  36.87 
 
 
379 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  39.9 
 
 
377 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  40.47 
 
 
398 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  38.38 
 
 
377 aa  258  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  38.24 
 
 
398 aa  252  7e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  41.51 
 
 
376 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  37.63 
 
 
392 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  37.4 
 
 
379 aa  243  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  36.01 
 
 
379 aa  231  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  41.25 
 
 
378 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  35.4 
 
 
376 aa  229  6e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  40.99 
 
 
378 aa  229  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  39.88 
 
 
385 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  33.6 
 
 
382 aa  219  7e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  36.75 
 
 
384 aa  218  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  33.69 
 
 
375 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  33.77 
 
 
382 aa  216  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  32.8 
 
 
378 aa  200  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  32.71 
 
 
382 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  35.46 
 
 
323 aa  189  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  34.23 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  35.71 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  35.27 
 
 
319 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  35.27 
 
 
319 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  35.27 
 
 
323 aa  176  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  36.78 
 
 
320 aa  164  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  32.65 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  29.1 
 
 
396 aa  146  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  30.4 
 
 
371 aa  144  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  32.28 
 
 
261 aa  144  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  32.28 
 
 
261 aa  144  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  31.6 
 
 
330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  32.06 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  29.58 
 
 
316 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  28.42 
 
 
301 aa  107  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  28.67 
 
 
303 aa  99.8  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.85 
 
 
618 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  30.35 
 
 
332 aa  96.7  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  29.63 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  27.11 
 
 
347 aa  90.1  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  28.92 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  29.12 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  24.7 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  26.27 
 
 
293 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  26.09 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  25.27 
 
 
505 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  26.97 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  26.88 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  27.44 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  28.62 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  26.36 
 
 
293 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  23.77 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  28.33 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  27.04 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  30.67 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  28.5 
 
 
282 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  25.48 
 
 
318 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1269  hypothetical protein  32.48 
 
 
427 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  22.65 
 
 
307 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  24.64 
 
 
358 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  22.04 
 
 
308 aa  63.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  34.46 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  24.22 
 
 
294 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  26.72 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  24.58 
 
 
442 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  26.34 
 
 
261 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  34.46 
 
 
375 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  23.23 
 
 
360 aa  60.5  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.41 
 
 
368 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  27.44 
 
 
433 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  32.48 
 
 
598 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.98 
 
 
368 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05370  4Fe-4S protein  38.1 
 
 
313 aa  56.2  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.716357  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0386  hypothetical protein  46.3 
 
 
434 aa  56.2  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.590413 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  26.18 
 
 
260 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  28.22 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
596 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2192  glycyl-radical activating family protein  42.11 
 
 
307 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.71 
 
 
442 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0132  ferredoxin  38.89 
 
 
58 aa  53.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.862186 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0879  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.41 
 
 
381 aa  53.5  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.68 
 
 
439 aa  53.1  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0445  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.18 
 
 
81 aa  53.5  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1265  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
58 aa  52.8  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.755601  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1610  flavoprotein  35.11 
 
 
239 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1568  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40 
 
 
58 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0508  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  36.78 
 
 
88 aa  52.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.988032  normal  0.01548 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0391  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.71 
 
 
81 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2979  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.4 
 
 
65 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.48 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000179459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2242  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  36.84 
 
 
314 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.99 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3421  ferredoxin  41.82 
 
 
58 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.14 
 
 
441 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>