More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0013 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
282 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.57 
 
 
283 aa  371  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0617  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 
284 aa  280  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000727568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.59 
 
 
287 aa  276  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1831  hypothetical protein  49.28 
 
 
285 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.48 
 
 
288 aa  264  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00176124  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0462  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.7 
 
 
285 aa  260  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.33 
 
 
285 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.41 
 
 
282 aa  252  6e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.58 
 
 
285 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0748  MinD family ATPase  42.76 
 
 
292 aa  248  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.13 
 
 
284 aa  248  8e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.200567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1954  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.55 
 
 
285 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1234  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.26 
 
 
281 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375656  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1585  MinD family ATPase  45.93 
 
 
282 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0658  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.78 
 
 
282 aa  242  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2427  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.6 
 
 
283 aa  240  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0565  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.28 
 
 
277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2222  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.66 
 
 
276 aa  232  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.21 
 
 
278 aa  230  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0195  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.7 
 
 
288 aa  229  5e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.65 
 
 
287 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.26 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.37 
 
 
293 aa  217  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.93 
 
 
652 aa  216  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0340  hypothetical protein  39.62 
 
 
268 aa  216  4e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00338872  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0442  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.08 
 
 
290 aa  203  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  38.85 
 
 
280 aa  202  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.01 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.46 
 
 
291 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.79 
 
 
301 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.72 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.526028  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  33.45 
 
 
311 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.57 
 
 
351 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.01 
 
 
286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.458285  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1445  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.29 
 
 
282 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.121455 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.27 
 
 
291 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000290019  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.25 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.96 
 
 
288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0441  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.69 
 
 
285 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0826  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.14 
 
 
286 aa  143  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.2 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.59 
 
 
296 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0615  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.2 
 
 
290 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176435  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0564  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.42 
 
 
286 aa  137  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18370  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.79 
 
 
288 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1984  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.2 
 
 
287 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3201  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  28.57 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.04 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1233  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.71 
 
 
286 aa  135  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.29 
 
 
292 aa  135  9e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  29.39 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.45 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.67 
 
 
306 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0747  MinD family ATPase  32.32 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.67 
 
 
287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1830  hypothetical protein  31.42 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.705168  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.99 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.44 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2426  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.92 
 
 
289 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.09 
 
 
290 aa  123  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.76 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100498  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1528  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.95 
 
 
288 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.539441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.92 
 
 
287 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.152479  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0657  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.81 
 
 
286 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145251  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1529  MinD family protein  30.18 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00592522  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.91 
 
 
292 aa  110  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29 
 
 
305 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2078  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.83 
 
 
275 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1588  MinD family ATPase  27.76 
 
 
291 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.57 
 
 
280 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000859922  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.81 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  24 
 
 
280 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1109  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  48.33 
 
 
365 aa  59.3  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.195082  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0750  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.26 
 
 
254 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.078886 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  42.42 
 
 
1105 aa  57.4  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.17 
 
 
270 aa  58.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.82 
 
 
370 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1318  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.22 
 
 
259 aa  55.8  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  41.67 
 
 
639 aa  55.8  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  50 
 
 
373 aa  55.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  40.62 
 
 
376 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  28.22 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0471  NADH dehydrogenase (quinone)  38.6 
 
 
620 aa  55.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000177124  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1153  ATPase  26.04 
 
 
361 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.91 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20271  hypothetical protein  26.04 
 
 
367 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2798  cell division inhibitor  23.51 
 
 
251 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.208643 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0377  2-oxoacid:acceptor oxidoreductase, delta subunit, pyruvate/2-ketoisovalerate  44.12 
 
 
89 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.03 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  22.59 
 
 
280 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.21 
 
 
210 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  23.45 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0220  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.5 
 
 
132 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.169897  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  64.29 
 
 
278 aa  52.8  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  24.81 
 
 
397 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  23.39 
 
 
288 aa  52.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0307  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  38.55 
 
 
85 aa  52.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.889115  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>