294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1687 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
293 aa  583  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1954  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.93 
 
 
285 aa  326  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1585  MinD family ATPase  53.79 
 
 
282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0748  MinD family ATPase  47.89 
 
 
292 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.87 
 
 
288 aa  276  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00176124  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.46 
 
 
284 aa  267  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.200567  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.46 
 
 
287 aa  256  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0658  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.48 
 
 
282 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.48 
 
 
293 aa  255  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1831  hypothetical protein  45.32 
 
 
285 aa  254  9e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0617  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.4 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000727568  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.09 
 
 
278 aa  241  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1234  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.09 
 
 
281 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375656  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.65 
 
 
289 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.526028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.41 
 
 
652 aa  236  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2427  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.77 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0565  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.26 
 
 
277 aa  233  3e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2222  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.01 
 
 
276 aa  228  8e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.3 
 
 
287 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.04 
 
 
283 aa  227  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0195  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.78 
 
 
288 aa  226  3e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.51 
 
 
282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.45 
 
 
283 aa  219  5e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.37 
 
 
282 aa  217  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.36 
 
 
285 aa  212  7e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0462  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.93 
 
 
285 aa  208  9e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.93 
 
 
285 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.89 
 
 
351 aa  202  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  41.28 
 
 
280 aa  202  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0340  hypothetical protein  43.5 
 
 
268 aa  201  9e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00338872  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  41.52 
 
 
311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.46 
 
 
291 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0442  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.97 
 
 
290 aa  190  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.31 
 
 
301 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.81 
 
 
286 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.458285  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  31.65 
 
 
293 aa  145  9e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2426  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.09 
 
 
289 aa  139  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3201  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  32.96 
 
 
308 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1233  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.17 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.69 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0615  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.52 
 
 
290 aa  127  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.97 
 
 
287 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0441  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.1 
 
 
285 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.19 
 
 
292 aa  123  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0657  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.69 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1445  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.62 
 
 
282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.121455 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.25 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1830  hypothetical protein  28.21 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.705168  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18370  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.43 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.23 
 
 
292 aa  115  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.46 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.46 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1528  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.46 
 
 
288 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.539441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.01 
 
 
291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000290019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1984  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.62 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.48 
 
 
292 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.54 
 
 
287 aa  112  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.152479  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0564  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.33 
 
 
286 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.78 
 
 
292 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1588  MinD family ATPase  32.02 
 
 
291 aa  102  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.15 
 
 
291 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0826  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.88 
 
 
286 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.84 
 
 
306 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.89 
 
 
290 aa  99.8  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.34 
 
 
292 aa  99.8  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.76 
 
 
305 aa  99.8  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2078  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.64 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0747  MinD family ATPase  30.43 
 
 
299 aa  96.3  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1529  MinD family protein  28.14 
 
 
288 aa  95.9  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00592522  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.54 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000859922  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.67 
 
 
288 aa  92.8  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.63 
 
 
267 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100498  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  33.72 
 
 
639 aa  57  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  24.83 
 
 
280 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.37 
 
 
308 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1089  iron-sulfur cluster-binding protein  38.36 
 
 
368 aa  52.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0040129  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1001  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.84 
 
 
656 aa  52.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0909  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.53 
 
 
657 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1173  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.03 
 
 
990 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.461948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0679  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.82 
 
 
717 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0157  hydrogenase, Fe-only  47.17 
 
 
523 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.434937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1425  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  35.11 
 
 
810 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0494363  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.27 
 
 
289 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2589  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  42.59 
 
 
792 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0800  hypothetical protein  46.3 
 
 
324 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  32.29 
 
 
417 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4506  iron-sulfur cluster-binding protein  44 
 
 
558 aa  50.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1774  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.86 
 
 
205 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  42.86 
 
 
1105 aa  50.1  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  25.6 
 
 
347 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.8 
 
 
367 aa  50.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  25.89 
 
 
416 aa  50.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.9 
 
 
553 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0748  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  30.43 
 
 
263 aa  49.3  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3150  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.15 
 
 
242 aa  49.3  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.568616  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.45 
 
 
289 aa  49.3  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0395  cell division ATPase MinD  26.11 
 
 
262 aa  48.9  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4316  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.65 
 
 
632 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.689523  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1524  cell division ATPase MinD  26.11 
 
 
262 aa  48.9  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.016628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>