More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1127 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0442  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.07 
 
 		 290 aa  295  9e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  49.82 
 
 		 311 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.39 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.200567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.17 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00176124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.62 
 
 		 282 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0748  MinD family ATPase  42.76 
 
 		 292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1585  MinD family ATPase  40.53 
 
 		 282 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.2 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.98 
 
 		 287 aa  215  9e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.86 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1831  hypothetical protein  42.49 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0617  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.22 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000727568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1954  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.42 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.18 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1234  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.29 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0462  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.78 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.11 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2427  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.38 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.78 
 
 		 285 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.4 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.526028  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0195  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.49 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0565  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.13 
 
 		 277 aa  197  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0658  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.36 
 
 		 282 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.79 
 
 		 282 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.71 
 
 		 291 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2222  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.61 
 
 		 276 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.95 
 
 		 652 aa  186  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  40.66 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.62 
 
 		 351 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.31 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.69 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0340  hypothetical protein  36.59 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00338872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1233  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.72 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1830  hypothetical protein  31.58 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.705168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0615  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.2 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176435  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1445  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.37 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.121455 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2426  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.83 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.26 
 
 		 286 aa  129  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.458285  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  32.84 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.1 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.57 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3201  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  32.12 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.57 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1984  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.15 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0441  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.45 
 
 		 285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18370  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.92 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.7 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1529  MinD family protein  30.19 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00592522  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2078  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.33 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.2 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0564  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.48 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.32 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.89 
 
 		 287 aa  108  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.152479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.84 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.21 
 
 		 287 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.17 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000290019  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.7 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.61 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0657  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.84 
 
 		 286 aa  99  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145251  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1588  MinD family ATPase  27.78 
 
 		 291 aa  99  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.63 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.51 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.85 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.15 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000859922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.19 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0826  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.3 
 
 		 290 aa  92.4  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1528  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.37 
 
 		 288 aa  89.4  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.539441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0747  MinD family ATPase  28.06 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  52.63 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3343  hypothetical protein  66.67 
 
 		 369 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  57.14 
 
 		 359 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.47 
 
 		 219 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  24.79 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  64.29 
 
 		 358 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  62.5 
 
 		 358 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  24.92 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.41 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  60.42 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  60.98 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.95 
 
 		 219 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  52.94 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  59.52 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  27.78 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0699  ParA family protein  27.78 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  60.98 
 
 		 357 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2973  ParA family protein  27.78 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510642  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  28.28 
 
 		 207 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  27.78 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.3 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1041  ParA family protein  27.78 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2314  ParA family protein  27.78 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0184356  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  63.41 
 
 		 368 aa  50.8  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.84 
 
 		 222 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.94 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  49.21 
 
 		 357 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>