More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1831 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1831  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0617  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.77 
 
 
284 aa  392  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000727568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.72 
 
 
287 aa  291  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.27 
 
 
284 aa  287  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.200567  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1234  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.18 
 
 
281 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375656  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1954  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.27 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1585  MinD family ATPase  49.28 
 
 
282 aa  281  7.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.58 
 
 
288 aa  278  6e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00176124  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.64 
 
 
278 aa  271  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.28 
 
 
282 aa  268  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2427  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.89 
 
 
283 aa  260  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0658  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.55 
 
 
282 aa  254  8e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.32 
 
 
293 aa  254  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0748  MinD family ATPase  47.14 
 
 
292 aa  251  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45 
 
 
283 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0565  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.64 
 
 
277 aa  249  5e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2222  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.79 
 
 
276 aa  248  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.09 
 
 
287 aa  246  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.29 
 
 
285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0195  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.94 
 
 
288 aa  241  1e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0462  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.55 
 
 
285 aa  240  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.5 
 
 
652 aa  239  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.48 
 
 
282 aa  238  8e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.18 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.62 
 
 
283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.9 
 
 
289 aa  229  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.526028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.64 
 
 
293 aa  228  8e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0442  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.33 
 
 
290 aa  226  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  43.93 
 
 
280 aa  222  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0340  hypothetical protein  43.31 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00338872  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.49 
 
 
301 aa  214  9e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  41.45 
 
 
311 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.86 
 
 
291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.86 
 
 
351 aa  194  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.89 
 
 
286 aa  160  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.458285  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.05 
 
 
290 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  33.46 
 
 
293 aa  142  8e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1233  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1445  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.28 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.121455 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.4 
 
 
291 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000290019  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.46 
 
 
282 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.46 
 
 
282 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.62 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1984  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.58 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.07 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1528  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.9 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.539441  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.21 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18370  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0615  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.3 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176435  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0826  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.71 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.9 
 
 
267 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100498  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0441  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 
285 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.44 
 
 
287 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.152479  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1830  hypothetical protein  28.05 
 
 
310 aa  123  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.705168  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.7 
 
 
296 aa  122  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3201  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  26.76 
 
 
308 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2426  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
289 aa  122  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.56 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1588  MinD family ATPase  31.54 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.47 
 
 
292 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.02 
 
 
287 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0564  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.2 
 
 
286 aa  119  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
290 aa  119  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.04 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0747  MinD family ATPase  29.76 
 
 
299 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0657  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.68 
 
 
286 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145251  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.8 
 
 
292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1529  MinD family protein  30.24 
 
 
288 aa  109  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00592522  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.17 
 
 
291 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.85 
 
 
306 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
280 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000859922  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.78 
 
 
305 aa  99  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2078  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.14 
 
 
275 aa  99  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  26.09 
 
 
280 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  25.08 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  27.54 
 
 
278 aa  60.8  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  24.67 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  24.21 
 
 
415 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0246  ATP/GTP-binding protein  27.8 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  23.13 
 
 
358 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  24.83 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 
266 aa  56.2  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  22.59 
 
 
357 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  26.5 
 
 
388 aa  55.8  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1296  Mrp protein  23.75 
 
 
359 aa  55.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.27319  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  23.29 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  23.45 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  24.2 
 
 
356 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  24.83 
 
 
363 aa  53.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  37.7 
 
 
639 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17681  hypothetical protein  22.7 
 
 
355 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.400744  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.44 
 
 
370 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  23.08 
 
 
347 aa  53.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  24.59 
 
 
362 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.32 
 
 
367 aa  52.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  23.78 
 
 
290 aa  52.8  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.75 
 
 
362 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  26.17 
 
 
372 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 
362 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.13 
 
 
289 aa  51.6  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>