More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1822 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 300 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72.24 
 
 		 298 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0670  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.18 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4779  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.49 
 
 		 299 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1849  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.87 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5246  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.49 
 
 		 299 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5321  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.27 
 
 		 301 aa  251  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4754  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.08 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.27 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  29.03 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.28 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2605  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.62 
 
 		 256 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  29.41 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  31.02 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.57 
 
 		 258 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.85 
 
 		 257 aa  93.2  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.26 
 
 		 270 aa  93.2  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.32 
 
 		 277 aa  92.8  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  30.19 
 
 		 276 aa  92.8  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  29.01 
 
 		 280 aa  92.4  9e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  27.86 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.13 
 
 		 257 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.62 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  30.53 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.94 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  31.94 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  28.26 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  32.99 
 
 		 260 aa  90.1  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.99 
 
 		 260 aa  90.1  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.94 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  31.87 
 
 		 268 aa  89.7  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  27.82 
 
 		 262 aa  89.7  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.47 
 
 		 255 aa  89.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.51 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.69 
 
 		 265 aa  89  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.41 
 
 		 263 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.42 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4349  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.97 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  30.57 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.46 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.77 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.77 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.77 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  30.77 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  30.77 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.77 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.81 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.77 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.77 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  32.11 
 
 		 332 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.1 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.85 
 
 		 317 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.77 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 		 261 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0095  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.82 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.740552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  30.69 
 
 		 265 aa  87.4  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  28.42 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 254 aa  87.4  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.64 
 
 		 259 aa  86.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.83 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.13 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  31.12 
 
 		 265 aa  87  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  32.83 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.91 
 
 		 264 aa  87  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  33.5 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  28.74 
 
 		 262 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.7 
 
 		 286 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  30.2 
 
 		 265 aa  86.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.18 
 
 		 268 aa  86.3  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 		 270 aa  86.3  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.48 
 
 		 284 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  31.61 
 
 		 258 aa  86.3  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3541  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.73 
 
 		 285 aa  85.9  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555008  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.3 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.3 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.69 
 
 		 265 aa  85.9  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.38 
 
 		 257 aa  85.9  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.36 
 
 		 259 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29 
 
 		 253 aa  85.9  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  31.79 
 
 		 255 aa  85.5  9e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  34.36 
 
 		 259 aa  85.9  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.31 
 
 		 264 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  30.89 
 
 		 262 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  30.89 
 
 		 262 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.29 
 
 		 253 aa  85.5  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.28 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  30.38 
 
 		 265 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.59 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.73 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  29.12 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.98 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.5 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 		 265 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  32.31 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.39 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.73 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.8 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  26.82 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.84 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>