More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4779 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4779  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
299 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862255  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5246  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  99.67 
 
 
299 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5321  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  91.97 
 
 
301 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1849  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.28 
 
 
300 aa  345  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933483  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0670  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.28 
 
 
300 aa  344  8.999999999999999e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.49 
 
 
300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.81 
 
 
298 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4754  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.28 
 
 
302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
350 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.77 
 
 
282 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.85 
 
 
277 aa  96.7  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  30.23 
 
 
284 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.08 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  35.86 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.97 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  30.07 
 
 
262 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  30.07 
 
 
262 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  29.58 
 
 
262 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  29.02 
 
 
262 aa  89.4  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.14 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.6 
 
 
264 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.14 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.54 
 
 
273 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.14 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.14 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.14 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.14 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  35.2 
 
 
276 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.22 
 
 
264 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.43 
 
 
278 aa  87.4  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.45 
 
 
265 aa  86.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.73 
 
 
253 aa  86.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  28.62 
 
 
262 aa  86.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  29.85 
 
 
253 aa  86.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  36.55 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29 
 
 
300 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.18 
 
 
299 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  30 
 
 
258 aa  85.5  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.42 
 
 
263 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  30.11 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  27.21 
 
 
257 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3854  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.07 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.460282  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.08 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.85 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.32 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  30.18 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.74 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  30.97 
 
 
285 aa  84  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  29.5 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.78 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.34 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  27.02 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  26.86 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.68 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  32.68 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  31.96 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.37 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.96 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.84 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  28.11 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.82 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.59 
 
 
257 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.33 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.3 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.83 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  30.48 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4840  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.69 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  29.87 
 
 
265 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.59 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  28.33 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.48 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.16 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.77 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.81 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.12 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.21 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.63 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.77 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.67 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  29.21 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.3 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.51 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  27.8 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.21 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.47 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.74 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.51 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.84 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.47 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  29.96 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.16 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.47 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  31.37 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3541  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.75 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555008  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  28.26 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.16 
 
 
403 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>