More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0670 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0670  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
300 aa  614  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1849  cobyrinic acid ac-diamide synthase  86.67 
 
 
300 aa  540  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933483  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5321  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.53 
 
 
301 aa  346  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5246  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.28 
 
 
299 aa  345  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4779  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.28 
 
 
299 aa  344  8.999999999999999e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862255  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.18 
 
 
300 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.8 
 
 
298 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4754  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.13 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.27 
 
 
350 aa  99.4  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.04 
 
 
263 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  30.04 
 
 
263 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.66 
 
 
263 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.04 
 
 
263 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  29.01 
 
 
265 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.3 
 
 
304 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  26.92 
 
 
256 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.14 
 
 
282 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  28.35 
 
 
263 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  26.92 
 
 
256 aa  85.9  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  28.96 
 
 
276 aa  85.9  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.35 
 
 
263 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.34 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  27.31 
 
 
264 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  28.74 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  28.74 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  29.23 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  35.83 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  28.74 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.8 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.63 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  28.72 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.49 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  27.86 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  34.22 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  28.29 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.97 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.29 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.09 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.09 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.09 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.48 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  28.36 
 
 
253 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.51 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  29.32 
 
 
254 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  27.78 
 
 
371 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  27.48 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.01 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.86 
 
 
403 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.23 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.72 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  27.41 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  25.67 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  26.05 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.87 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.06 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0878  histone-like DNA-binding protein  29.15 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147294  normal  0.0243793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  26.46 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2474  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.86 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00522516  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  27.47 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.57 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  27.47 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  27.47 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  26.32 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  26.74 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.47 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  31.03 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.63 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.03 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  27.03 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.94 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  27.27 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  29.73 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.01 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.46 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0040  ParaA family ATPase  32.42 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00514136  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.54 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.48 
 
 
255 aa  79  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  31.96 
 
 
257 aa  79  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6366  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
274 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0439498  normal  0.30299 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.35 
 
 
263 aa  79  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  26.05 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 
253 aa  79  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  28.19 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.85 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.04 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4349  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.18 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  28.79 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  32.83 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  30.93 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  31.55 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3966  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.35 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  29.85 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.96 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.76 
 
 
264 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0047  replication-associated protein  32.42 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.02 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  25.76 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>