More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5321 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5321  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
301 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4779  cobyrinic acid ac-diamide synthase  91.97 
 
 
299 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862255  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5246  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  91.64 
 
 
299 aa  560  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1849  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.28 
 
 
300 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933483  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0670  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.53 
 
 
300 aa  346  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.27 
 
 
300 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.62 
 
 
298 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4754  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.87 
 
 
302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.57 
 
 
350 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.06 
 
 
277 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.24 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  30.62 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.68 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  33.33 
 
 
264 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.68 
 
 
264 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  36.36 
 
 
265 aa  92  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  30.77 
 
 
253 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.84 
 
 
262 aa  90.1  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.46 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.68 
 
 
253 aa  90.1  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.78 
 
 
262 aa  89.7  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 
264 aa  89  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  32.51 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  32.51 
 
 
262 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  32.51 
 
 
262 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  30.77 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  30.83 
 
 
264 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  32.34 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.55 
 
 
259 aa  87.4  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.58 
 
 
304 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  29.74 
 
 
254 aa  87  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.34 
 
 
262 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  29.68 
 
 
258 aa  87.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.34 
 
 
262 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.78 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.34 
 
 
262 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.34 
 
 
262 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.43 
 
 
262 aa  86.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  29.58 
 
 
262 aa  86.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.42 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  31.46 
 
 
276 aa  86.7  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.82 
 
 
284 aa  86.3  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.46 
 
 
284 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.12 
 
 
277 aa  85.9  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  31.47 
 
 
268 aa  85.5  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.95 
 
 
289 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.38 
 
 
273 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.34 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.08 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.29 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  29.34 
 
 
263 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.47 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.34 
 
 
263 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.52 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.96 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.08 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.33 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  27.02 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.99 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  31.66 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.51 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  27.8 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.14 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  30.12 
 
 
268 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.32 
 
 
260 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.09 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.3 
 
 
278 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  35.32 
 
 
260 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.66 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  31.27 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  31.54 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3541  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.54 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.66 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A20  ATPase involved in chromosome partitioning  32.96 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.814657  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  29.81 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.08 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.47 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.31 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.54 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  28.31 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  31.48 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  30.8 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  28.3 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  26.67 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2605  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.62 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  26.15 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.57 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.12 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.99 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  30.51 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  30.51 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.46 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  29.31 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2474  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.5 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00522516  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.76 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  30.41 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.48 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  28.03 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>