More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1849 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1849  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
300 aa  614  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933483  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0670  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  86.67 
 
 
300 aa  540  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5321  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.28 
 
 
301 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4779  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.28 
 
 
299 aa  345  7e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862255  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5246  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.28 
 
 
299 aa  343  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.87 
 
 
300 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.49 
 
 
298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4754  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.61 
 
 
302 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.6 
 
 
350 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.81 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  30.27 
 
 
263 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.27 
 
 
263 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.89 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.5 
 
 
263 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  29.18 
 
 
284 aa  87  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.16 
 
 
258 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.34 
 
 
261 aa  85.9  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.81 
 
 
282 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  34.02 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.9 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.23 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  29.29 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  33.33 
 
 
265 aa  84  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  29.29 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  29.29 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  28.51 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.03 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  29.43 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  27.21 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2581  ATPase domain protein  33.03 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000379448  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.58 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.13 
 
 
263 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  29.32 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.54 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  31.96 
 
 
262 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.99 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  31.91 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2474  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.88 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00522516  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  30.77 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  33.51 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.93 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  32.12 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  31.28 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  30.89 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.46 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.18 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.71 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.12 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.71 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.85 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4349  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.05 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  31.94 
 
 
397 aa  79.3  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  33.68 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.54 
 
 
262 aa  79  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  33.68 
 
 
262 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  28.21 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  31.44 
 
 
268 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.52 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  30.05 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.38 
 
 
263 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.54 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 
261 aa  79  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.12 
 
 
262 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  31.88 
 
 
264 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  30.85 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  31.16 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.93 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.5 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.88 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  31.84 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.05 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.44 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  30.12 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  32.09 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  30.93 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.12 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  28.03 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  32.88 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  30.65 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.54 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  28 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.85 
 
 
254 aa  77  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.85 
 
 
282 aa  77  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.42 
 
 
264 aa  77  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.83 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.64 
 
 
317 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.59 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.19 
 
 
273 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.46 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  33.67 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  33.51 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  33.67 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  29.28 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>