58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1337 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1337  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
226 aa  449  1e-125  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1342  chromosome partitioning ATPase  40.77 
 
 
241 aa  190  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.565259  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1401  hypothetical protein  40.71 
 
 
242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145922 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  45.03 
 
 
291 aa  133  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0147  conserved hypothetical protein  30.89 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0380838  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1334  hypothetical protein  27.43 
 
 
230 aa  59.7  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1592  hypothetical protein  31.69 
 
 
150 aa  54.7  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0145604 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E12  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  29.35 
 
 
252 aa  52.4  0.000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0519  hypothetical protein  30.69 
 
 
259 aa  52  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.185936  normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  33.86 
 
 
365 aa  50.1  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.46 
 
 
383 aa  48.5  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0956  chromosome partitioning ATPase  35.05 
 
 
256 aa  47.8  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0593249  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  35.96 
 
 
371 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0234  hypothetical protein  45.16 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.168768 
 
 
-
 
NC_011735  BbuZS7_X32  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  54.55 
 
 
260 aa  47  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0000524469  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC19  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  56.25 
 
 
246 aa  47  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.433322  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  32.18 
 
 
409 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0150  conserved hypothetical protein  45.61 
 
 
206 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
NC_011785  BbuZS7_I17  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  54.55 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.461136  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC58  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  35.35 
 
 
251 aa  45.8  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146529  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2249  conserved hypothetical protein  35.29 
 
 
247 aa  45.8  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  24.77 
 
 
265 aa  45.8  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011731  BbuZS7_P35  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  54.55 
 
 
246 aa  45.4  0.0006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000108757  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  29.89 
 
 
405 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1509  ParaA family ATPase  37.19 
 
 
287 aa  45.4  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1341  hypothetical protein  50 
 
 
266 aa  45.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1281  septum site-determining protein MinD  27.88 
 
 
263 aa  45.1  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0634588  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.83 
 
 
220 aa  45.1  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0366  histidinol phosphatase  32.47 
 
 
288 aa  44.7  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00129205  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0368  ParaA family ATPase  50.98 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141266  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  32.94 
 
 
484 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.73 
 
 
407 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011784  BbuZS7_A17  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  33.33 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.22705  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.55 
 
 
283 aa  43.5  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0159  hypothetical protein  32.98 
 
 
237 aa  42.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.9 
 
 
469 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0260  septum site-determining protein MinD  30.67 
 
 
273 aa  43.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.148495  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  30.69 
 
 
364 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.1 
 
 
260 aa  43.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3017  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.94 
 
 
439 aa  42.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000106278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.44 
 
 
210 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  28.72 
 
 
291 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  34.33 
 
 
397 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5285  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.29 
 
 
270 aa  42  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158504  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2543  septum site-determining protein MinD  27.27 
 
 
264 aa  42  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  29.89 
 
 
404 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.18 
 
 
408 aa  42  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4634  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.59 
 
 
238 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6822  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.45 
 
 
269 aa  42  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  29.53 
 
 
293 aa  42  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  32.29 
 
 
295 aa  42  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  42 
 
 
259 aa  41.6  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  43.75 
 
 
399 aa  41.6  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3342  arsenite-activated ATPase ArsA  41.82 
 
 
643 aa  41.6  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  28.42 
 
 
290 aa  41.6  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19821  predicted protein  31.25 
 
 
368 aa  41.6  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0914  chromosome partitioning ATPase  47.83 
 
 
246 aa  41.6  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.800283  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.08 
 
 
289 aa  41.6  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>