45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1342 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1342  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
241 aa  478  1e-134  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.565259  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1401  hypothetical protein  46.98 
 
 
242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145922 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  64.2 
 
 
291 aa  219  3e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1337  chromosome partitioning ATPase  40.77 
 
 
226 aa  190  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0147  conserved hypothetical protein  27.8 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0380838  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0519  hypothetical protein  29.2 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.185936  normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0234  hypothetical protein  27.38 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.168768 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0260  septum site-determining protein MinD  30 
 
 
273 aa  52.4  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.148495  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  34.88 
 
 
365 aa  52.4  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0914  chromosome partitioning ATPase  28.27 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.800283  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1592  hypothetical protein  31.2 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0145604 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1341  hypothetical protein  29.92 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1334  hypothetical protein  22.33 
 
 
230 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2249  conserved hypothetical protein  24.71 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2139  arsenite-activated ATPase ArsA  47.06 
 
 
587 aa  46.6  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1491  arsenite-activated ATPase (arsA)  47.06 
 
 
587 aa  46.6  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.738172  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2546  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.96 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2637  anion-transporting ATPase  41.07 
 
 
590 aa  45.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.473292  normal  0.577432 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1273  MRP family ATP-binding protein  30.89 
 
 
245 aa  45.4  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0109668  normal 
 
 
-
 
NC_011785  BbuZS7_I17  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  37.62 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.461136  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0956  chromosome partitioning ATPase  25.56 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0593249  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3664  arsenite-activated ATPase (arsA)  40.91 
 
 
589 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5095  arsenite-activated ATPase ArsA  47.06 
 
 
729 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0696  anion-transporting ATPase  39.06 
 
 
314 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.04 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0150  conserved hypothetical protein  50 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3342  arsenite-activated ATPase ArsA  45.45 
 
 
643 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  30.33 
 
 
341 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  28.06 
 
 
408 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.58 
 
 
397 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  28.57 
 
 
291 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.62 
 
 
404 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03090  NBP35, putative  31.15 
 
 
336 aa  43.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.820324  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  31.5 
 
 
278 aa  43.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  33.33 
 
 
301 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.79 
 
 
223 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3828  arsenite-activated ATPase ArsA  44 
 
 
588 aa  42.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000120267  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  30.95 
 
 
278 aa  42.7  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2343  arsenite-activated ATPase ArsA  44 
 
 
588 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000653299  normal  0.0206512 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.89 
 
 
383 aa  42.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0209  arsenite-activated ATPase ArsA  40.68 
 
 
621 aa  42  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.88 
 
 
401 aa  42  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.22 
 
 
283 aa  42  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1763  septum site-determining protein MinD  26.32 
 
 
271 aa  41.6  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000014274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1654  arsenite-activated ATPase ArsA  45.1 
 
 
589 aa  42  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>