15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0147 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0147  conserved hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  507  1e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0380838  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1401  hypothetical protein  30.46 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145922 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1337  chromosome partitioning ATPase  30.89 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1342  chromosome partitioning ATPase  27.8 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.565259  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  30.77 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0248  hypothetical protein  26.02 
 
 
195 aa  50.4  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598961  normal  0.906781 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1592  hypothetical protein  30.95 
 
 
150 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0145604 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1334  hypothetical protein  31.3 
 
 
230 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2249  conserved hypothetical protein  30.34 
 
 
247 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0519  hypothetical protein  26.94 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.185936  normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  40.51 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4907  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
290 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0234  hypothetical protein  24.44 
 
 
285 aa  43.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.168768 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.18 
 
 
397 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
283 aa  42  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>