25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0404 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0404  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0519  hypothetical protein  45.2 
 
 		 259 aa  206  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.185936  normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1341  hypothetical protein  41.13 
 
 		 266 aa  165  5e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0956  chromosome partitioning ATPase  30.59 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0593249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0234  hypothetical protein  30.08 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.168768 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0985  hypothetical protein  33.49 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.126225 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0950  hypothetical protein  30.77 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.208772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1344  hypothetical protein  31.21 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0145  conserved hypothetical protein  29.11 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.199985  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0248  hypothetical protein  30.59 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598961  normal  0.906781 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0453  hypothetical protein  27.71 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1401  hypothetical protein  30.43 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145922 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1343  hypothetical protein  51.85 
 
 		 81 aa  53.9  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.43391  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2249  conserved hypothetical protein  22.8 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1342  chromosome partitioning ATPase  25.6 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.565259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1337  chromosome partitioning ATPase  28.76 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.62 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1365  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.84 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.625193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.21 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  43.1 
 
 		 348 aa  42.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  27.13 
 
 		 253 aa  42.4  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.28 
 
 		 213 aa  42.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.09 
 
 		 256 aa  42  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000176763 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1450  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.7 
 
 		 305 aa  42  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000235787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>