More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0855 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  100 
 
 
365 aa  763    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2287  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.47 
 
 
366 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1422  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.92 
 
 
366 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.482848  normal  0.726821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.34 
 
 
353 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1214  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 
330 aa  150  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.11 
 
 
354 aa  146  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.08 
 
 
472 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.14 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.05 
 
 
323 aa  126  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.22 
 
 
340 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2565  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.82 
 
 
330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3115  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.33 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.42 
 
 
338 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.31 
 
 
340 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0540093  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0988  regulatory protein CII  28.11 
 
 
343 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2369  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.45 
 
 
342 aa  107  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5376  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.62 
 
 
443 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00931432  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3667  regulatory protein CII  25.94 
 
 
356 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.48 
 
 
322 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.69 
 
 
313 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.63 
 
 
298 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.41 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.24 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0435  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.47 
 
 
279 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2181  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.93 
 
 
306 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000966803  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  27.14 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  26.17 
 
 
255 aa  77  0.0000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  25.78 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  25.28 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.89 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.75 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.29 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  25.19 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  25.56 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5321  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.25 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.19 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1849  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933483  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49030  hypothetical protein  26.97 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000408552  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.37 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4754  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.16 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.37 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  27.65 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  29.81 
 
 
408 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1728  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.05 
 
 
273 aa  72.4  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4779  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.38 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862255  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1555  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.56 
 
 
313 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.69 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.99 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  25.19 
 
 
257 aa  72  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2506  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.83 
 
 
272 aa  72  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5246  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.38 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.24 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0670  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.33 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.4 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.85 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.4 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  24.91 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  26.12 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0058  putative ParA chromosome partitioning protein  30.32 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.35 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  26.23 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.53 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.24 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.44 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.99 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.05 
 
 
267 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.16 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.21 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.05 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.52 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  26.79 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  26.29 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.12 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  25.56 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.72 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.76 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  26.29 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  27.05 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.36 
 
 
282 aa  67  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A20  ATPase involved in chromosome partitioning  27.88 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.814657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.96 
 
 
259 aa  67  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.99 
 
 
253 aa  67  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.68 
 
 
255 aa  67  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  25.96 
 
 
264 aa  67  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.45 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.1 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.05 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  26.36 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  26.36 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3541  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.81 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555008  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.52 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  27.01 
 
 
460 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.33 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.76 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  22.42 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>