More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2565 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2565  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
330 aa  681    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.07 
 
 
340 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1214  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.02 
 
 
330 aa  158  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.14 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.66 
 
 
472 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.63 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.29 
 
 
338 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.89 
 
 
353 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.75 
 
 
354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  26.82 
 
 
365 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2287  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.53 
 
 
366 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0988  regulatory protein CII  26.42 
 
 
343 aa  106  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3115  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.91 
 
 
353 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.59 
 
 
340 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0540093  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1422  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.42 
 
 
366 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.482848  normal  0.726821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5376  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.27 
 
 
443 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00931432  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3667  regulatory protein CII  27.5 
 
 
356 aa  95.9  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2041  putative chromosome partitioning protein ParA, ATPase  31.79 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93461  normal  0.236522 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.47 
 
 
254 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.3 
 
 
254 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.3 
 
 
254 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.97066  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6545  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.26 
 
 
254 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952996  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6104  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.23 
 
 
254 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2785  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.23 
 
 
254 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2160  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.23 
 
 
254 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2774  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.23 
 
 
254 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.16 
 
 
259 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1912  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.28 
 
 
263 aa  86.7  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.96 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.69 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.55 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1454  ParA family protein  31.5 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00493427  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  29.38 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.38 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  30.93 
 
 
257 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2369  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.66 
 
 
342 aa  82.4  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.68 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4669  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.93 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal  0.373093 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.16 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0468  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.61 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.66 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.68 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.52 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.35 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  31.82 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  33.17 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31 
 
 
262 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  33.68 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49030  hypothetical protein  24.32 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000408552  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3714  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.36 
 
 
281 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  30 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.28 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.85 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.84 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  29.44 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  30.46 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  32.32 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.95 
 
 
293 aa  77  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.98 
 
 
362 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2605  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.44 
 
 
256 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  31.98 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0435  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.48 
 
 
279 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  30.81 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1728  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.58 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.21 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.34 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  30 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.22 
 
 
259 aa  75.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  28.79 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.73 
 
 
257 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  31.53 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.04 
 
 
260 aa  75.5  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  30.46 
 
 
257 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.96 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.73 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 
264 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  31.34 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.58 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  31.34 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  30.46 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  30.1 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.05 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  32.51 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.93 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  31.12 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.86 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.08 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  30.57 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.99 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.85 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4190  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  29.65 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  29.65 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  29.65 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  30.57 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>