More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3115 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3115  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
353 aa  730    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5376  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.59 
 
 
443 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00931432  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2369  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.06 
 
 
342 aa  226  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0988  regulatory protein CII  31.74 
 
 
343 aa  169  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1214  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.22 
 
 
330 aa  157  3e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3667  regulatory protein CII  29.92 
 
 
356 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49030  hypothetical protein  30.99 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000408552  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.53 
 
 
353 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.39 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.59 
 
 
354 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.8 
 
 
338 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  29.33 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2287  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.07 
 
 
366 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.25 
 
 
327 aa  110  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.58 
 
 
472 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.84 
 
 
340 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2565  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.91 
 
 
330 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1422  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.18 
 
 
366 aa  96.3  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.482848  normal  0.726821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.48 
 
 
340 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0540093  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.1 
 
 
313 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.18 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.53 
 
 
322 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1555  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.46 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0435  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.99 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0058  putative ParA chromosome partitioning protein  28.7 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.56 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.69 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  32.12 
 
 
256 aa  75.9  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.71 
 
 
254 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.5 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  30.29 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.75 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  32.99 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.07 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  32.16 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  30.1 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  32.51 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1320  chromosome segregation ATPase  31.88 
 
 
259 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.06 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1058  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.92 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.56 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.95 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.05 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  30.15 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  28.64 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2181  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.46 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000966803  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  31.53 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.41 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.76 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  31.61 
 
 
370 aa  69.7  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  28.5 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.35 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.81 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.86 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.77 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  32.16 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.26 
 
 
410 aa  69.3  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  29.59 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.31 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.06 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.06 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.38 
 
 
255 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  31.61 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.94 
 
 
264 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.65 
 
 
277 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.06 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.12 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.28 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4349  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.84 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3714  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.1 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  30 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1397  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.91 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000218596  hitchhiker  0.000285063 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.26 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.58 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1454  chromosome partitioning protein  25.71 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.11 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.64 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  31.46 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  31.37 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  28.43 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.71 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  31.94 
 
 
256 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  29.06 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.94 
 
 
256 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.59 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.92 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  31.94 
 
 
256 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.94 
 
 
256 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.94 
 
 
256 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.08 
 
 
249 aa  67  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.94 
 
 
256 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.03 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  31.94 
 
 
256 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.74 
 
 
259 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.85 
 
 
262 aa  67  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.63 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.72 
 
 
339 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.09 
 
 
256 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>