More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0193 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
472 aa  919    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.29 
 
 
327 aa  330  4e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.52 
 
 
323 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.45 
 
 
338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.13 
 
 
354 aa  289  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.67 
 
 
353 aa  280  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.32 
 
 
340 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0540093  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1214  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.82 
 
 
330 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2287  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.8 
 
 
366 aa  156  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1422  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.22 
 
 
366 aa  150  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.482848  normal  0.726821 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2565  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.66 
 
 
330 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  28.08 
 
 
365 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.9 
 
 
340 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0988  regulatory protein CII  27.46 
 
 
343 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3667  regulatory protein CII  28.17 
 
 
356 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2369  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.75 
 
 
342 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3115  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.58 
 
 
353 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5376  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.35 
 
 
443 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00931432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49030  hypothetical protein  27.09 
 
 
343 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000408552  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  32.23 
 
 
290 aa  87.4  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.76 
 
 
330 aa  87  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.64 
 
 
322 aa  87  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.29 
 
 
282 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0991  ATPase domain-containing protein  27.62 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.440755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3190  ATPase domain-containing protein  30.77 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000797397  unclonable  0.000049795 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  33.51 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  33.68 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.39 
 
 
312 aa  83.2  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  33.68 
 
 
397 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.17 
 
 
398 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.95 
 
 
255 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.68 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  35.53 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.55 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  30.54 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  31.43 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  27.65 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.94 
 
 
404 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.21 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  30.95 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  34.18 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.44 
 
 
408 aa  79.7  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.92 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 
401 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.11 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.84 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.53 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  34 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  36.13 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.94 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.8 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  31.05 
 
 
405 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.58 
 
 
313 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.72 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00797726  normal  0.771866 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.09 
 
 
264 aa  77  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  34.27 
 
 
404 aa  77  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.55 
 
 
322 aa  77  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.62 
 
 
293 aa  77  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.44 
 
 
265 aa  77  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.2 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  32.11 
 
 
405 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.34 
 
 
279 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.78 
 
 
303 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.02 
 
 
339 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  31.05 
 
 
405 aa  76.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.34 
 
 
290 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.34 
 
 
290 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  31.95 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.51 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  27.92 
 
 
258 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  28.79 
 
 
264 aa  75.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.47 
 
 
299 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  30.81 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  29.47 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  27.78 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.91 
 
 
407 aa  75.1  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.47 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  33.16 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.09 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.89 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.23 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.81 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.5 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.86 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  29.47 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.51 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  29.49 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  31.55 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  27.32 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  34.69 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  33.17 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  33.81 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  28.86 
 
 
327 aa  73.2  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  31.34 
 
 
268 aa  73.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.12 
 
 
352 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.89 
 
 
404 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  34.55 
 
 
408 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>