More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4486 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
340 aa  687    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0540093  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.3 
 
 
323 aa  265  7e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.61 
 
 
472 aa  255  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.05 
 
 
338 aa  250  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.54 
 
 
327 aa  240  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.42 
 
 
354 aa  215  9e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.68 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1214  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.35 
 
 
330 aa  160  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3667  regulatory protein CII  26.76 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2287  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.3 
 
 
366 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1422  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.85 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.482848  normal  0.726821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  26.71 
 
 
365 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2565  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.59 
 
 
330 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0988  regulatory protein CII  23.43 
 
 
343 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.15 
 
 
340 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49030  hypothetical protein  27.36 
 
 
343 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000408552  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3115  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.99 
 
 
353 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5376  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.91 
 
 
443 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00931432  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2369  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.32 
 
 
342 aa  87.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.01 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  33.5 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.19 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.99 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  29.56 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.48 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.2 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.92 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  31.37 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.34 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.97 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  33.16 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.922179 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.16 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  29.65 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  33.16 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.43 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3517  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.22 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5494  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.59 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188231 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  29.47 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.66 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.23 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.55 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00797726  normal  0.771866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.54 
 
 
367 aa  69.3  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  31.96 
 
 
259 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
261 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.71 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.05 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  32.8 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.57 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0022  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.14 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.695943  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  24.62 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  30.39 
 
 
253 aa  67  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  31.44 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.03 
 
 
433 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.55 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.47 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0121  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.63 
 
 
264 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.35 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  32.14 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.12 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.14 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  29.06 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.32 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.16 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  30.77 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  28.21 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.18 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  28.1 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.27 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  28.43 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  30 
 
 
262 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  30.14 
 
 
319 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.14 
 
 
262 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.15 
 
 
252 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.7 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.57 
 
 
264 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.94 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4159  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.7 
 
 
258 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2956  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 
272 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  31.63 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.14 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  29.9 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.5 
 
 
258 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.56 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.94 
 
 
264 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.63 
 
 
263 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  30.61 
 
 
408 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.65 
 
 
307 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.63 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.96 
 
 
255 aa  63.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.36 
 
 
250 aa  63.5  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.14 
 
 
261 aa  63.5  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.38 
 
 
395 aa  63.2  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>