More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_49030 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_49030  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  707    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000408552  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3667  regulatory protein CII  38.18 
 
 
356 aa  257  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0988  regulatory protein CII  35.63 
 
 
343 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3115  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.99 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5376  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.6 
 
 
443 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00931432  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1214  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.33 
 
 
330 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.75 
 
 
327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2369  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.15 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.71 
 
 
338 aa  113  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.14 
 
 
323 aa  109  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.04 
 
 
340 aa  99.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0540093  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.09 
 
 
472 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.55 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.16 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2287  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.78 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2565  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.32 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1422  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.45 
 
 
366 aa  75.9  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.482848  normal  0.726821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.07 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  26.97 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1555  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.82 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3786  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.55 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116138  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  29.69 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  30.85 
 
 
256 aa  67  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.3 
 
 
290 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.33 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.3 
 
 
290 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0576  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.15 
 
 
314 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.3 
 
 
279 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
267 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.1 
 
 
282 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3190  ATPase domain-containing protein  26.29 
 
 
359 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000797397  unclonable  0.000049795 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.21 
 
 
264 aa  62.8  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0095  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.77 
 
 
293 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0435  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.06 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0022  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.74 
 
 
257 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.695943  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.22 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.37 
 
 
274 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  26.37 
 
 
274 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  27.17 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  32.45 
 
 
259 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.85 
 
 
255 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  25.13 
 
 
257 aa  60.1  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.91 
 
 
303 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.72 
 
 
277 aa  59.3  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.74 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.91 
 
 
298 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0058  putative ParA chromosome partitioning protein  25.63 
 
 
265 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E12  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  25.67 
 
 
252 aa  58.9  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.13 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  27.09 
 
 
258 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.56 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.56 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.43 
 
 
257 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.26 
 
 
282 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  21.93 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.55 
 
 
254 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.46 
 
 
300 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
254 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4349  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.64 
 
 
295 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3056  ParaA family ATPase  28.33 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.41 
 
 
277 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.58 
 
 
254 aa  58.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  24.62 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.25 
 
 
259 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.27 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 
273 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.18 
 
 
273 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.24 
 
 
265 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2979  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.35 
 
 
257 aa  57.4  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5529  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.46 
 
 
258 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.151881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.91 
 
 
279 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
257 aa  57.4  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.36 
 
 
322 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  26.7 
 
 
265 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.8 
 
 
262 aa  56.6  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  24.12 
 
 
257 aa  56.6  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26 
 
 
262 aa  56.6  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08227  chromosome partitioning protein ParA  29.61 
 
 
255 aa  56.2  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000521031  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0121  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.06 
 
 
264 aa  56.6  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.5 
 
 
255 aa  56.6  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1365  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.9 
 
 
272 aa  56.2  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.625193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  24.74 
 
 
276 aa  55.8  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0991  ATPase domain-containing protein  22.32 
 
 
360 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.440755  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  28.27 
 
 
258 aa  55.5  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  25.78 
 
 
251 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.87 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  28.36 
 
 
262 aa  55.5  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  30.32 
 
 
253 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5494  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.06 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3120  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.86 
 
 
307 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136524  normal  0.126924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.43 
 
 
330 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  24.53 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  24.53 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4519  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.44 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  27.13 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1116  chromosome partitioning ATPase  26.23 
 
 
259 aa  54.7  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.897501  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.61 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00000188924  normal  0.759718 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  25.63 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  25.25 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>