More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3190 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3190  ATPase domain-containing protein  100 
 
 
359 aa  745    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000797397  unclonable  0.000049795 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0991  ATPase domain-containing protein  57.02 
 
 
360 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.440755  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4106  ATPase domain-containing protein  35.33 
 
 
355 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000114229  unclonable  0.0000000119877 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0397  ATPase domain-containing protein  33.84 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0187  ATPase  34.69 
 
 
339 aa  169  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000236407  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2258  ATPase domain protein  33.73 
 
 
360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2633  ATPase  32.59 
 
 
340 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.839220000000001e-18  decreased coverage  0.0000000173501 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0439  ATPase  32.72 
 
 
340 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000906876  unclonable  0.0000000000000120536 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3749  ATPase domain-containing protein  31.36 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000275778  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0093  hypothetical protein  29.97 
 
 
338 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000000492521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2581  ATPase domain protein  29.6 
 
 
339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000379448  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
472 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2181  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.8 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000966803  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.89 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.03 
 
 
257 aa  69.3  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  31.19 
 
 
361 aa  69.3  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.85 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.48 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2377  chromosome partitioning ATPase  21.91 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.0000000329135  unclonable  0.0000000236411 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3714  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.19 
 
 
281 aa  67  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.86 
 
 
327 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  29.85 
 
 
279 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.34 
 
 
265 aa  63.9  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49030  hypothetical protein  26.29 
 
 
343 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000408552  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  30.39 
 
 
263 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.39 
 
 
263 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  29.9 
 
 
265 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.44 
 
 
277 aa  62.4  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.39 
 
 
263 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.78 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  27.59 
 
 
262 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  29.9 
 
 
259 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 
323 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.39 
 
 
263 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.86 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4218  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.08 
 
 
452 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  27.88 
 
 
263 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  28.08 
 
 
262 aa  60.1  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3120  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.5 
 
 
307 aa  60.1  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136524  normal  0.126924 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.59 
 
 
258 aa  60.1  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.88 
 
 
263 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
322 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  27.32 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  27.32 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  27.32 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.54 
 
 
298 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.12 
 
 
338 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.49 
 
 
261 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4840  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.76 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  25.85 
 
 
257 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.32 
 
 
262 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  28.22 
 
 
274 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  28.5 
 
 
256 aa  57.4  0.0000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.22 
 
 
274 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.05 
 
 
273 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  26.92 
 
 
257 aa  57  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  28.71 
 
 
260 aa  57  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  27.59 
 
 
268 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  28.71 
 
 
255 aa  56.6  0.0000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 
254 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.56 
 
 
336 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1058  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.11 
 
 
259 aa  56.2  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.87 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.21 
 
 
254 aa  55.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1320  chromosome segregation ATPase  30.85 
 
 
259 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.73 
 
 
256 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.84 
 
 
262 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  25.17 
 
 
279 aa  55.8  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.86 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.24 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.83 
 
 
286 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  31.37 
 
 
273 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1176  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 
254 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291287  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2774  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.44 
 
 
296 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.32 
 
 
262 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  25.84 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4754  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.64 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.96 
 
 
264 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.32 
 
 
263 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  28.86 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  29.41 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.12 
 
 
260 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  25.87 
 
 
265 aa  54.7  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  28.92 
 
 
266 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.87 
 
 
265 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.61 
 
 
340 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 
294 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 
262 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1849  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.98 
 
 
300 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933483  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3115  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.24 
 
 
353 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 
294 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 
262 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 
262 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  27.65 
 
 
256 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.8 
 
 
257 aa  53.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.32 
 
 
339 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2565  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.23 
 
 
330 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
318 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.24 
 
 
265 aa  53.5  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  26.73 
 
 
262 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>