More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0991 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0991  ATPase domain-containing protein  100 
 
 
360 aa  739    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.440755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3190  ATPase domain-containing protein  56.47 
 
 
359 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000797397  unclonable  0.000049795 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0397  ATPase domain-containing protein  33.94 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4106  ATPase domain-containing protein  36.53 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000114229  unclonable  0.0000000119877 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2258  ATPase domain protein  33.54 
 
 
360 aa  169  9e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0439  ATPase  35.49 
 
 
340 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000906876  unclonable  0.0000000000000120536 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3749  ATPase domain-containing protein  31.18 
 
 
340 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000275778  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0093  hypothetical protein  31.37 
 
 
338 aa  156  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000000492521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0187  ATPase  33.33 
 
 
339 aa  155  7e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000236407  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2633  ATPase  33.75 
 
 
340 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.839220000000001e-18  decreased coverage  0.0000000173501 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2581  ATPase domain protein  30.38 
 
 
339 aa  143  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000379448  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2377  chromosome partitioning ATPase  26.75 
 
 
346 aa  89.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.0000000329135  unclonable  0.0000000236411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.62 
 
 
472 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0987  partition protein, ParA-like  27.02 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.000325119  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.06 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  29.06 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.07 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.88 
 
 
313 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3714  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 
281 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  29.27 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.37 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  29.76 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2181  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  21.7 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000966803  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  28.37 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  28.08 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.37 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  29.27 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.88 
 
 
263 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1728  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.69 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  28.71 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.56 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.69 
 
 
264 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.9 
 
 
257 aa  65.1  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.16 
 
 
300 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  30.05 
 
 
266 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.43 
 
 
270 aa  63.9  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  27.7 
 
 
279 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.66 
 
 
264 aa  63.2  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  26.83 
 
 
361 aa  62.8  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  28.37 
 
 
262 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2565  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.84 
 
 
330 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.42 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.8 
 
 
298 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.18 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.15 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.18 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49030  hypothetical protein  23.33 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000408552  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.92 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  30.57 
 
 
460 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1058  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.59 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.28 
 
 
256 aa  62  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.18 
 
 
257 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 
262 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 
262 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  26.6 
 
 
273 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.6 
 
 
273 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 
262 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  26.11 
 
 
263 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.85 
 
 
264 aa  60.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.73 
 
 
256 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.6 
 
 
259 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 
262 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.41 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.64 
 
 
262 aa  60.5  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.09 
 
 
262 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  27.59 
 
 
262 aa  60.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1320  chromosome segregation ATPase  28.08 
 
 
259 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.98 
 
 
257 aa  60.1  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  27.59 
 
 
262 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  27.59 
 
 
262 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  27.09 
 
 
262 aa  60.1  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.1 
 
 
329 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.74 
 
 
250 aa  59.7  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
261 aa  59.7  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.49 
 
 
263 aa  59.7  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
261 aa  59.7  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.03 
 
 
255 aa  59.3  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.88 
 
 
273 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1214  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.6 
 
 
330 aa  59.3  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.85 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.32 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.11 
 
 
263 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.96 
 
 
265 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.83 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 
286 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  27.32 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.4 
 
 
295 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0058  putative ParA chromosome partitioning protein  27.23 
 
 
265 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  27.09 
 
 
262 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.9 
 
 
254 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  26.35 
 
 
254 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  28.16 
 
 
262 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.19 
 
 
297 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  27.59 
 
 
262 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.1 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.59 
 
 
262 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>