More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1555 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1555  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
313 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0744  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.57 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000594465  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.56 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0441  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.93 
 
 
314 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000798578  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0920  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.93 
 
 
314 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000171601  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.24 
 
 
277 aa  123  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
322 aa  122  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4349  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.8 
 
 
295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.82 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.82 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  27.81 
 
 
284 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.2 
 
 
304 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2947  chromosome partitioning ATPase  27.94 
 
 
294 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000147107  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3541  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.5 
 
 
285 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555008  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.41 
 
 
282 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
330 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2474  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.34 
 
 
294 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00522516  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 
350 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.09 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.25 
 
 
258 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0435  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.5 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.02 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.09 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.09 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.5 
 
 
257 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.41 
 
 
265 aa  94.4  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  32.06 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  32.06 
 
 
257 aa  92.4  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.28 
 
 
257 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  28.57 
 
 
327 aa  90.9  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.28 
 
 
257 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.49 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2181  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.75 
 
 
306 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000966803  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  33.51 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.49 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.49 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  30.56 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.51 
 
 
257 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.49 
 
 
262 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.91 
 
 
268 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  30.66 
 
 
257 aa  90.1  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3786  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.91 
 
 
255 aa  90.1  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116138  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 
298 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.16 
 
 
303 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  32.49 
 
 
262 aa  89.4  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  28.44 
 
 
256 aa  89.4  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33 
 
 
262 aa  89.4  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  28.57 
 
 
332 aa  89.4  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  32 
 
 
262 aa  89  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  27.98 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.33 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3592  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.04 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.8 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  30.14 
 
 
257 aa  88.6  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  29.36 
 
 
258 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.79 
 
 
302 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  25.77 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  31.5 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  31.5 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.37 
 
 
362 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0095  ParA family chromosome partitioning ATPase  31.25 
 
 
261 aa  87  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.92 
 
 
273 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0135  ParA family chromosome partitioning ATPase  31.25 
 
 
261 aa  87  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  29.3 
 
 
276 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0107  ParA family chromosome partitioning ATPase  31.25 
 
 
261 aa  87  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.85 
 
 
251 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.11 
 
 
299 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  29.8 
 
 
318 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  29.91 
 
 
314 aa  86.3  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31 
 
 
264 aa  86.3  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0113  chromosome segregation ATPase  27.44 
 
 
256 aa  86.3  6e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  31.65 
 
 
259 aa  86.3  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.06 
 
 
263 aa  85.9  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
261 aa  85.9  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.68 
 
 
470 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  25.7 
 
 
279 aa  85.9  8e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  34.65 
 
 
279 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.65 
 
 
303 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.26 
 
 
339 aa  85.9  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  29.55 
 
 
255 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  30.4 
 
 
253 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4754  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.28 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  30.66 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.77 
 
 
259 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.17 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  31.58 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.368871  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.38 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0871  ParA family protein  30.18 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.401351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.19 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  30.59 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  30.04 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.53 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00367255  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  29.63 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  30.19 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  28.52 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>