63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0391 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
259 aa  535  1e-151  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  59.76 
 
 
259 aa  327  2.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  56.35 
 
 
253 aa  318  5e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  56.35 
 
 
253 aa  318  5e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  57.2 
 
 
255 aa  317  1e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  59.06 
 
 
263 aa  316  2e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  57.66 
 
 
254 aa  300  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  52.71 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  47.79 
 
 
254 aa  224  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  45 
 
 
246 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  46.77 
 
 
253 aa  215  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  43.08 
 
 
257 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  43.87 
 
 
261 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  39.52 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  41.9 
 
 
261 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  41.5 
 
 
261 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  41.38 
 
 
244 aa  192  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  39.84 
 
 
263 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  41.67 
 
 
263 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  41.67 
 
 
263 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  39.53 
 
 
257 aa  191  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  39.51 
 
 
244 aa  188  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  38.15 
 
 
279 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  38.06 
 
 
257 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  39.27 
 
 
277 aa  186  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  38.31 
 
 
346 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  39.13 
 
 
271 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  39.41 
 
 
243 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  39.06 
 
 
266 aa  182  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  38.06 
 
 
278 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  38.06 
 
 
278 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  38.87 
 
 
247 aa  181  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  36.44 
 
 
278 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  36.59 
 
 
253 aa  175  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  52.63 
 
 
291 aa  133  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  29.68 
 
 
508 aa  97.1  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 
370 aa  96.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 
344 aa  85.9  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  31 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  26.63 
 
 
417 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 
392 aa  54.3  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  27.86 
 
 
393 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  28.06 
 
 
378 aa  53.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  25.69 
 
 
406 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  25.35 
 
 
406 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0320  beta-lactamase domain-containing protein  23.87 
 
 
388 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  23.58 
 
 
396 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.36 
 
 
575 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.36 
 
 
575 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  23.41 
 
 
397 aa  45.4  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0533  metallo-beta-lactamase family protein  35.29 
 
 
52 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000264713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  25.13 
 
 
213 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  22.97 
 
 
395 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  23.26 
 
 
395 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
393 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  27.4 
 
 
391 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0834  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.48 
 
 
573 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.293861  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 
400 aa  43.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  25.24 
 
 
508 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  23.53 
 
 
414 aa  42.4  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  25.41 
 
 
400 aa  42.4  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>