80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0995 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 246 aa  513  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  49.58 
 
 		 244 aa  249  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  47.5 
 
 		 243 aa  244  9e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  45.61 
 
 		 244 aa  238  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  44.35 
 
 		 246 aa  237  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  44.17 
 
 		 257 aa  232  3e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  44.49 
 
 		 253 aa  228  5e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  44.49 
 
 		 253 aa  228  5e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  42.08 
 
 		 259 aa  224  7e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  41.98 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  45 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  41.25 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  39.75 
 
 		 255 aa  200  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  40.91 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  40.82 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  43.11 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  39.43 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  39.76 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  35.12 
 
 		 247 aa  182  6e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  38.96 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  38.55 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  39.09 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  37.76 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  37.3 
 
 		 277 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  41.1 
 
 		 271 aa  175  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  36.93 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  36.51 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  36.51 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  41.1 
 
 		 279 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  40.18 
 
 		 346 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  37.1 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  37.1 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  39.45 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  34.84 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  45.45 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  24.53 
 
 		 508 aa  79.3  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  23.55 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  25.54 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  25.57 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  22.43 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  23.29 
 
 		 399 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  23.29 
 
 		 399 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  22.45 
 
 		 395 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  23.85 
 
 		 878 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 		 395 aa  53.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  23.39 
 
 		 878 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  24.52 
 
 		 396 aa  52.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0174  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.22 
 
 		 398 aa  52.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0172  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.96 
 
 		 398 aa  52  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 		 395 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  22.27 
 
 		 393 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  21.17 
 
 		 400 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  24.6 
 
 		 393 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  20.39 
 
 		 378 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0614  beta-lactamase domain protein  22.02 
 
 		 395 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  25.47 
 
 		 209 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  22.75 
 
 		 508 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  24.12 
 
 		 387 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 		 387 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  23.33 
 
 		 418 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  20.89 
 
 		 402 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  23.22 
 
 		 407 aa  45.4  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  25.85 
 
 		 392 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1078  metallo-beta-lactamase family protein  21.43 
 
 		 408 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  21.08 
 
 		 884 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  21 
 
 		 392 aa  44.3  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3660  beta-lactamase domain-containing protein  27.15 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  22.11 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1920  beta-lactamase domain protein  22.52 
 
 		 393 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5452  beta-lactamase domain-containing protein  25.36 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0473701 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  24.64 
 
 		 402 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  21.57 
 
 		 407 aa  42.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  20.26 
 
 		 396 aa  42.7  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  22.92 
 
 		 406 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  22.92 
 
 		 406 aa  42  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  22.61 
 
 		 399 aa  42  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2557  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 263 aa  42  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.583667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>