60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0991 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
278 aa  574  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  89.21 
 
 
278 aa  520  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  89.21 
 
 
278 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  86.03 
 
 
275 aa  490  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  79.34 
 
 
277 aa  464  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  62.6 
 
 
253 aa  323  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  53.91 
 
 
263 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  53.79 
 
 
346 aa  308  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  54.37 
 
 
279 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  52.94 
 
 
257 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  52.65 
 
 
271 aa  301  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  51.18 
 
 
257 aa  294  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  51.55 
 
 
257 aa  278  6e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  49.25 
 
 
261 aa  277  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  49.43 
 
 
261 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  48.3 
 
 
261 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  46.1 
 
 
266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  46.88 
 
 
263 aa  255  7e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  46.88 
 
 
263 aa  255  7e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  41.27 
 
 
254 aa  217  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  41.11 
 
 
253 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  39.56 
 
 
257 aa  193  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
247 aa  193  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  36.9 
 
 
259 aa  186  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  36.69 
 
 
253 aa  186  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  36.69 
 
 
253 aa  186  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  38.93 
 
 
254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  39.39 
 
 
263 aa  183  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  37.4 
 
 
255 aa  181  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  40.51 
 
 
244 aa  175  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  36.93 
 
 
246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  36.44 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  37.87 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  36.75 
 
 
246 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  35.9 
 
 
244 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  38.1 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  24.78 
 
 
508 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 
370 aa  72  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 
344 aa  63.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  27.46 
 
 
387 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  24.07 
 
 
387 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  21.29 
 
 
392 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  24.54 
 
 
397 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  24.65 
 
 
387 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  25.59 
 
 
406 aa  52.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  27.07 
 
 
403 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  25.73 
 
 
371 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  25.87 
 
 
393 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  20.95 
 
 
402 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  25.33 
 
 
508 aa  48.9  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  24.64 
 
 
406 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1859  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.66 
 
 
585 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  26.57 
 
 
351 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 
396 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  26.12 
 
 
391 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  20.18 
 
 
402 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  23.44 
 
 
374 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  21.28 
 
 
400 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 
399 aa  42.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0044  flavoprotein  22.43 
 
 
591 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>