57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0700 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
257 aa  521  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  59.51 
 
 
253 aa  324  9e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  59.51 
 
 
253 aa  324  9e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  57.37 
 
 
263 aa  315  6e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  57.66 
 
 
259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  56.63 
 
 
254 aa  289  4e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  52.71 
 
 
259 aa  281  6.000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  51.76 
 
 
255 aa  280  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  44.17 
 
 
246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  44.27 
 
 
253 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  43.57 
 
 
244 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  44.22 
 
 
254 aa  216  4e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  43.65 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  45.97 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  43.25 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  41.46 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  41.42 
 
 
243 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  43.1 
 
 
246 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  41.73 
 
 
266 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  41.78 
 
 
278 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  41.78 
 
 
278 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  40.76 
 
 
244 aa  201  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  40.08 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  38.52 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  40.44 
 
 
275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  40.96 
 
 
263 aa  195  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  40.96 
 
 
263 aa  195  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  39.11 
 
 
257 aa  194  8.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  40.43 
 
 
277 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  37.4 
 
 
263 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  39.56 
 
 
278 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  37.1 
 
 
279 aa  192  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  35.88 
 
 
346 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  36.36 
 
 
257 aa  188  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  36.03 
 
 
253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  46.15 
 
 
291 aa  135  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  30.25 
 
 
508 aa  99.8  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 
370 aa  85.1  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  30.84 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 
344 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 
387 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 
387 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0172  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.44 
 
 
398 aa  48.5  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  23.5 
 
 
393 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0174  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.67 
 
 
398 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  23.01 
 
 
418 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  30.47 
 
 
213 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  27.01 
 
 
397 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  25.12 
 
 
508 aa  45.4  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  25.65 
 
 
392 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  25.98 
 
 
387 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  24.15 
 
 
406 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  24.15 
 
 
406 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  25.12 
 
 
392 aa  43.5  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0533  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
52 aa  42.7  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000264713  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
400 aa  42.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>