48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6137 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  524  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  56.45 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  46.09 
 
 		 261 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  46.48 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  47.84 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  47.84 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  46.51 
 
 		 263 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  46.51 
 
 		 263 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  46.46 
 
 		 257 aa  229  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  44.31 
 
 		 261 aa  225  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  45.88 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  45.31 
 
 		 257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  45.88 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  44.27 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  46.09 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  44.76 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  47.04 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  44.76 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  46.34 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  43.82 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  42.69 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  43.43 
 
 		 263 aa  208  6e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  42.29 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  44.4 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  42.29 
 
 		 277 aa  205  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  42.29 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  43.6 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  42.29 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  41.11 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  41.7 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  40.82 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  36.73 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  37.1 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  35.66 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  35.37 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  45.3 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  28.57 
 
 		 508 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  28.96 
 
 		 370 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 374 aa  62  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  25.15 
 
 		 406 aa  52.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  24.31 
 
 		 393 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  23.24 
 
 		 406 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  24.65 
 
 		 378 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  21.66 
 
 		 392 aa  44.3  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  24.38 
 
 		 397 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 		 217 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>